RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532573.1

DERA-208, Transcript of deoxyribose-phosphate aldolase, human

TSL 3

Gene DERA, Length 387 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DERA-208	ENST00000532573	DGKE	P52429	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	TUBB3	Q13509	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	STARD3	Q14849	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	NELL2	Q99435	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	NFAT5	O94916	1531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573		A0A087WV62	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	NDST3	O95803	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PEX11B	O96011	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	KCNA3	P22001	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CD6	P30203	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	GRM1	Q13255	1194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	E2F2	Q14209	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	GDF15	Q99988	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573		A0A087WZ62	844 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FFAR2	O15552	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	LPXN	O60711	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SPDEF	O95238	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	RASAL1	O95294	804 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	COPA	P53621	1224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	ITGA8	P53708	1063 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PRKAG1	P54619	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	TRIM14	Q14142	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	ICE2	Q659A1	982 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DERA-208	ENST00000532573	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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