RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 SPRY2O43597 315 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 KELP23276 732 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 CERS1P27544 350 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 DIO1P49895 249 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 DAG1Q14118 895 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 FAM187BQ17R55 369 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 DENND2CQ68D51 928 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 SNX15Q9NRS6 342 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 HPSEQ9Y251 543 aa5.09□□□□□ -1.59
CPEB4-210ENST00000522344 USP1O94782 785 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 IL18RAPO95256 599 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 LATS1O95835 1130 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 CD19P15391 556 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGAP25P42331 645 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 PIK3CBP42338 1070 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF81P51508 661 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF626Q68DY1 528 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM65Q6PI78 240 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 IQCDQ96DY2 449 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC46Q96FV0 321 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ASIC5Q9NY37 505 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.08□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 POM121BA6NF01 834 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 M0R3H8 397 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 THAP12O43422 761 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 TMPRSS11DO60235 418 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 TUBB4AP04350 444 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 AWAT1Q58HT5 328 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 MANEALQ5VSG8 457 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 MZT2AQ6P582 158 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 USP49Q70CQ1 688 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 NEK8Q86SG6 692 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 KRT78Q8N1N4 520 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 VPS50Q96JG6 964 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF778Q96MU6 729 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.07□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM232C9JQI7 657 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 MT-CO3P00414 261 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 A1BGP04217 495 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 PHKG2P15735 406 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 DEUP1Q05D60 604 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 P3H2Q8IVL5 708 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 TBCBQ99426 244 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 USP29Q9HBJ7 922 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.05□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 MYL3P08590 195 aa5.05□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 RBL1P28749 1068 aa5.05□□□□□ -1.6
CPEB4-210ENST00000522344 ATICP31939 592 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms