RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519081.1

RNU6-988P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 988, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-988P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-988P-201ENST00000519081 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SPC25Q9HBM1 224 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 CPA4Q9UI42 421 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SPEF1Q9Y4P9 236 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MYO1CO00159 1063 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 EPN2O95208 641 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 CREB1P16220 341 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCND1P24385 295 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TNFRSF8P28908 595 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 UQCRC1P31930 480 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MCM5P33992 734 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 EVA1CP58658 441 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 RAB1AP62820 205 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 AMPD3Q01432 767 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 STIM1Q13586 685 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 VSTM1Q6UX27 236 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 RFX6Q8HWS3 928 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 ASB5Q8WWX0 329 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 HPS3Q969F9 1004 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SNX15Q9NRS6 342 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAFFQ9ULX9 164 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 LACTBL1A8MY62 500 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM233B4DJY2 109 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 BTN3A1O00481 513 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 RRHO14718 337 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMPRSS11DO60235 418 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 NGFRP08138 427 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 NPR1P16066 1061 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 EPHA3P29320 983 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 ARRB2P32121 409 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 DEUP1Q05D60 604 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCDC157Q569K6 752 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 DCAF12L1Q5VU92 463 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 DENND2CQ68D51 928 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SPARTQ8N0X7 666 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 HSPBAP1Q96EW2 488 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TM2D2Q9BX73 214 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 FZD4Q9ULV1 537 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 USP22Q9UPT9 525 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 IFITM10A6NMD0 228 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 ALG1L2C9J202 215 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 AGPSO00116 658 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TGFB3P10600 412 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 HOXB2P14652 356 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TACR3P29371 465 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 CPA2P48052 419 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 GPC5P78333 572 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 FGL2Q14314 439 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAML1Q92585 1016 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC25A28Q96A46 364 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 P2RY11Q96G91 374 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 HIC2Q96JB3 615 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 NLRP4Q96MN2 994 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 SELENONQ9NZV5 590 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 STAP2Q9UGK3 403 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-988P-201ENST00000519081 A0A0G2JK05 382 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 FYB1O15117 783 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 SPTLC2O15270 562 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 INPPL1O15357 1258 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-988P-201ENST00000519081 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms