RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SPATA5Q8NB90 893 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CGRRF1Q99675 332 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF185O15231 689 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CKBP12277 381 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TYRP14679 529 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 MECOMQ03112 1051 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC157Q569K6 752 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 C17orf99Q6UX52 265 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF365Q70YC5 407 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF276Q8N554 614 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 HTTP42858 3142 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CDHR4A6H8M9 788 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PDHXO00330 501 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 MATN3O15232 486 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 BAG3O95817 575 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CAPN2P17655 700 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 HOXD10P28358 340 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TUBA3CQ13748 450 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CERS3Q8IU89 383 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF384Q8TF68 577 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF333Q96JL9 665 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 VPS11Q9H270 941 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PNPOQ9NVS9 261 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 RLIMQ9NVW2 624 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TNNQ9UQP3 1299 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PPFIA4O75335 1185 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 UBXN7O94888 489 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 PRSS23O95084 383 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TNFRSF1AP19438 455 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 PIK3CGP48736 1102 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 DGCR2P98153 550 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 PDSS2Q86YH6 399 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF747Q9BV97 191 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 RAI14Q9P0K7 980 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 PI4KBQ9UBF8 816 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 ADGRA2Q96PE1 1338 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1B0GTW7 788 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-225ENST00000515835 H3BUI4 141 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms