RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GYS1	P13807	737 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HSD3B1	P14060	373 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC5A2	P31639	672 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAPK9	P45984	424 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GATM	P50440	423 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GUCY1B3	Q02153	619 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FOXO1	Q12778	655 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATP1A4	Q13733	1029 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GPR149	Q86SP6	731 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SSH3	Q8TE77	659 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DKK2	Q9UBU2	259 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CA14	Q9ULX7	337 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	USP22	Q9UPT9	525 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PZP	P20742	1482 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CEP170	Q5SW79	1584 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DAPK1	P53355	1430 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADGRL2	O95490	1459 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HMX3	A6NHT5	357 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784		J3KTA2	159 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACTL6B	O94805	426 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GLP2R	O95838	553 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RHO	P08100	348 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITGA2B	P08514	1039 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITGAM	P11215	1152 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF20	P17024	532 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLRK1	P26718	216 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RBL1	P28749	1068 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EPHA3	P29320	983 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AKT1	P31749	480 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MTHFS	P49914	203 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DGCR2	P98153	550 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDSN	Q15517	529 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TBCC	Q15814	346 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SYNE4	Q8N205	404 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ASB10	Q8WXI3	467 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GLG1	Q92896	1179 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GCC1	Q96CN9	775 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EID2B	Q96D98	161 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HAPLN3	Q96S86	360 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GLOD4	Q9HC38	313 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CASS4	Q9NQ75	786 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VPS51	Q9UID3	782 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IQGAP2	Q13576	1575 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LAMC1	P11047	1609 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		3.62	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		3.62	□□□□□ -1.83

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