RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 MID2Q9UJV3 735 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 KAT6AQ92794 2004 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ANO9A1A5B4 782 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 RAB27BO00194 218 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CCP110O43303 1012 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 IL1R1P14778 569 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 BCAT1P54687 386 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 GRM1Q13255 1194 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 SEMA5AQ13591 1074 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ALFQ53S48 1182 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TISP43B9A030 160 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 EXOC3O60645 756 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PIAS2O75928 621 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PRKCBP05771 671 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CELA2AP08217 269 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 HGFP14210 728 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ACVR2AP27037 513 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 SERPINB3P29508 390 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PRKAR1BP31321 381 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGEF7Q14155 803 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PDILTQ8N807 584 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CIPCQ9C0C6 399 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CHST8Q9H2A9 424 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PSMD9O00233 223 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CES2O00748 559 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 APAF1O14727 1248 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 LDHCP07864 332 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PHKG2P15735 406 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 UQCRC1P31930 480 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 GKP32189 559 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 MTHFSP49914 203 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CPT1AP50416 773 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TUBA4AP68366 448 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PSG6Q00889 435 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 STK3Q13188 491 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 SLC29A2Q14542 456 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 FCRL6Q6DN72 434 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC174Q6PII3 467 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 UNC13DQ70J99 1090 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CHSY1Q86X52 802 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TERB1Q8NA31 727 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 MMS19Q96T76 1030 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM5Q9C035 493 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 USP22Q9UPT9 525 aa5.61□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 F8W8V4 182 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 TIMM44O43615 452 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PMPCBO75439 489 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 LATS1O95835 1130 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CDK4P11802 303 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 LMO1P25800 156 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 EPHA3P29320 983 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 MPGP29372 298 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 HALP42357 657 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 RENBPP51606 427 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 NPY5RQ15761 445 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 YAF2Q8IY57 180 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 AMFRQ9UKV5 643 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 FAM50BQ9Y247 325 aa5.6□□□□□ -1.51
PDE4D-215ENST00000506510 PRRT4C9JH25 899 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms