RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 PPP2R2AP63151 447 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TFDP2Q14188 446 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MORF4L2Q15014 288 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PTGISQ16647 500 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FUKQ8N0W3 1084 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DUSP16Q9BY84 665 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MIOSQ9NXC5 875 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PADI3Q9ULW8 664 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF487B1APH4 448 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RASGRF2O14827 1237 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ACSL3O95573 720 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 IVLP07476 585 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 LCP1P13796 627 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 THPOP40225 353 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RAB27AP51159 221 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CLCNKBP51801 687 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HDAC4P56524 1084 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GUCY1A3Q02108 690 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GPS1Q13098 491 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MMRN1Q13201 1228 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NOMO1Q15155 1222 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 WSCD1Q658N2 575 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD5Q6N075 450 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PCGF5Q86SE9 256 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 LPPQ93052 612 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SENP8Q96LD8 212 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PWWP2AQ96N64 755 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RNF157Q96PX1 679 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MCF2LO15068 1137 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ATP2C2O75185 946 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 AGTP01019 485 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NPR3P17342 541 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 IL4RP24394 825 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CD52P31358 61 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 LHX1P48742 406 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GDF10P55107 478 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SLC8A3P57103 927 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PTK7Q13308 1070 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DSC3Q14574 896 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 KYNUQ16719 465 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PIGZQ86VD9 579 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NLRC5Q86WI3 1866 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PATJQ8NI35 1801 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TLDC2A0PJX2 215 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MGEA5O60502 916 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TCEA3O75764 348 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 IFNB1P01574 187 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RBP3P10745 1247 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GHRP10912 638 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 LSP1P33241 339 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SCNN1GP51170 649 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 KRT81Q14533 505 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 LPIN1Q14693 890 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DPYSL2Q16555 572 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 UPP1Q16831 310 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC142Q17RM4 750 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FAM26DQ5JW98 314 aa8.55□□□□□ -1.04
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