RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 E2F8A0AVK6 867 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 MAP3K13O43283 966 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 COCHO43405 550 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 EXOC3O60645 756 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 RHOBTB3O94955 611 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 TNNI1P19237 187 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 YWHAQP27348 245 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 GAD2Q05329 585 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 KDSRQ06136 332 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PSMD6Q15008 389 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 NUP93Q8N1F7 819 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 HMGB4Q8WW32 186 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF516Q92618 1163 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 GATA6Q92908 595 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 CGRRF1Q99675 332 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 A8MXQ7 604 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 KIF20AO95235 890 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 ENGP17813 658 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 MAPK8P45983 427 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 MYL6P60660 151 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 TNNC1P63316 161 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 CYP24A1Q07973 514 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 NAT16Q8N8M0 369 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 FBXO32Q969P5 355 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 OTUB2Q96DC9 234 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 KCNK16Q96T55 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 IL37Q9NZH6 218 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 HCN2Q9UL51 889 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PDXKO00764 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 ITPKAP23677 461 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 DPP6P42658 865 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 HECTD3Q5T447 861 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PIP4P1Q86T03 277 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 PGBD3Q8N328 593 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 WBP2Q969T9 261 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC32A1Q9H598 525 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 EML5Q05BV3 1969 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-205ENST00000502260 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 OBSL1O75147 1896 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 TRIM24O15164 1050 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 TULP3O75386 442 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 NR3C1P04150 777 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 ATICP31939 592 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC5A3P53794 718 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 CDH8P55286 799 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 SEMA3BQ13214 749 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 TRPC3Q13507 836 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 PNOCQ13519 176 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM25Q86YD3 366 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms