RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 TERB1Q8NA31 727 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 DPF1Q92782 380 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 TTC17Q96AE7 1141 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 ASB2Q96Q27 587 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 USP19O94966 1318 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 WIPF3A6NGB9 483 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CES2O00748 559 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 TPP1O14773 563 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 PIAS2O75928 621 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 TUBB4AP04350 444 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 MYF5P13349 255 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 TPH1P17752 444 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 ACVR2AP27037 513 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 PEX2P28328 305 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 EPHB2P29323 1055 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 GKP32189 559 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 MICU3Q86XE3 530 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 OR56A3Q8NH54 315 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 TRIM5Q9C035 493 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CIPCQ9C0C6 399 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.65□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 KIF14Q15058 1648 aa5.65□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MADDQ8WXG6 1647 aa5.65□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.65□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.65□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PRRT4C9JH25 899 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 BTBD19C9JJ37 291 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 AP4M1O00189 453 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PPP6CO00743 305 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TMPRSS11DO60235 418 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 GCATO75600 419 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RNF8O76064 485 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 KELP23276 732 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CPT1AP50416 773 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 FMO1Q01740 532 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TFF2Q03403 129 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 DDB2Q92466 427 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MAML1Q92585 1016 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CCDC17Q96LX7 622 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 NUP62CLQ9H1M0 184 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MAFFQ9ULX9 164 aa5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 REREQ9P2R6 1566 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MYO5CQ9NQX4 1742 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CGB1A6NKQ9 187 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RAB27BO00194 218 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 SNX2O60749 519 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PMPCBO75439 489 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PRR35P0CG20 571 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 CYP2D6P10635 497 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PLCD1P51178 756 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PGDP52209 483 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 LY6KQ17RY6 165 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 MTX3Q5HYI7 312 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 NEK8Q86SG6 692 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PRR25Q96S07 402 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 STK32BQ9NY57 414 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 SCAPERQ9BY12 1400 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 ATP10AO60312 1499 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 LMTK3Q96Q04 1460 aa5.63□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TMEM232C9JQI7 657 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 H7C4K7 107 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 PDE8BO95263 885 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 FGAP02671 866 aa5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RBM39-241ENST00000496183 UQCRC1P31930 480 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms