RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495949.1

RALGAPB-208, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 3

Gene RALGAPB, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-208	ENST00000495949	TBCK	Q8TEA7	893 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	FERMT2	Q96AC1	680 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	USP28	Q96RU2	1077 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	RAB34	Q9BZG1	259 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	MROH8	Q9H579	483 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ACAD9	Q9H845	621 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	RNF146	Q9NTX7	359 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PFAS	O15067	1338 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949		A0A0G2JMZ2	1700 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	BTBD19	C9JJ37	291 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	MEIS2	O14770	477 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	HSD17B4	P51659	736 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	NOG	Q13253	232 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	NPY5R	Q15761	445 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	UBE2S	Q16763	222 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	LETM2	Q2VYF4	491 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	RABL3	Q5HYI8	236 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ADAL	Q6DHV7	355 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ST8SIA2	Q92186	375 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	NINJ1	Q92982	152 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PRRX2	Q99811	253 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ANO3	Q9BYT9	981 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	FANCL	Q9NW38	375 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	MSRA	Q9UJ68	235 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	CLIC4	Q9Y696	253 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	STRN	O43815	780 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	NEMF	O60524	1076 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ALDH1A2	O94788	518 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	KRT4	P19013	534 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PTGS2	P35354	604 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	SREBF1	P36956	1147 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	GHRHR	Q02643	423 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	CD69	Q07108	199 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	KCTD2	Q14681	263 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	WDR78	Q5VTH9	848 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949		Q6ZPA2	131 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	REPS2	Q8NFH8	660 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	NRP1	O14786	923 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	STAM2	O75886	525 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	CYP3A4	P08684	503 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	FCER1A	P12319	257 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	CCND2	P30279	289 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	PRPH	P41219	470 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	TM4SF4	P48230	202 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	GRM1	Q13255	1194 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RALGAPB-208	ENST00000495949	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24

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