RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 ATP2A3Q93084 1043 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-214ENST00000490425 WBP2Q969T9 261 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-214ENST00000490425 ZSWIM1Q9BR11 485 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-214ENST00000490425 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-214ENST00000490425 ECT2Q9H8V3 914 aa12.66□□□□□ -0.38
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NISCH-214ENST00000490425 USP3Q9Y6I4 520 aa12.66□□□□□ -0.38
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NISCH-214ENST00000490425 C1orf228Q6PIY5 440 aa12.65□□□□□ -0.38
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NISCH-214ENST00000490425 KIAA1257Q9ULG3 409 aa12.65□□□□□ -0.38
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NISCH-214ENST00000490425 NFATC1O95644 943 aa12.64□□□□□ -0.39
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NISCH-214ENST00000490425 BST2Q10589 180 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
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NISCH-214ENST00000490425 C10orf120Q5SQS8 335 aa12.64□□□□□ -0.39
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NISCH-214ENST00000490425 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
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NISCH-214ENST00000490425 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.39
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NISCH-214ENST00000490425 C2orf42Q9NWW7 574 aa12.63□□□□□ -0.39
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NISCH-214ENST00000490425 DNMT3LQ9UJW3 386 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-214ENST00000490425 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-214ENST00000490425 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-214ENST00000490425 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-214ENST00000490425 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-214ENST00000490425 ATG2BQ96BY7 2078 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-214ENST00000490425 MYOFQ9NZM1 2061 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-214ENST00000490425 GPR179Q6PRD1 2367 aa12.62□□□□□ -0.39
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