RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ITIH2P19823 946 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LPIN1Q14693 890 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 COG1Q8WTW3 980 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 WNT8BQ93098 351 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RMDN1Q96DB5 314 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DCLK3Q9C098 648 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ERICH4A6NGS2 130 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ACSL3O95573 720 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ABCB6Q9NP58 842 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ESYT3A0FGR9 886 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NCAM2O15394 837 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CYP1A2P05177 515 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 APRTP07741 180 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ACRP10323 421 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MAMLD1Q13495 774 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LAMB3Q13751 1172 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM192Q8IY95 271 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KAT2BQ92831 832 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SCYL1Q96KG9 808 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 O00370 1275 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TTI1O43156 1089 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TADA3O75528 432 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KRT37O76014 449 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NOL4O94818 638 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GLUD1P00367 558 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MT-ND3P03897 115 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FAM163BP0C2L3 166 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 C1QTNF8P60827 252 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MTFR1Q15390 333 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 HIF1AQ16665 826 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 HECTD3Q5T447 861 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DDI1Q8WTU0 396 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ISCUQ9H1K1 167 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ASAH2Q9NR71 780 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 L1RE1Q9UN81 338 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PITPNM1O00562 1244 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GLI1P08151 1106 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 AMPD2Q01433 879 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ADCY2Q08462 1091 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CES5AQ6NT32 575 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 JAMLQ86YT9 394 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CNPY4Q8N129 248 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 UCMAQ8WVF2 138 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 INSL6Q9Y581 213 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CALCAP01258 141 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SETDB1Q15047 1291 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 E2F5Q15329 346 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FAM71BQ8TC56 605 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 USP33Q8TEY7 942 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RNF39Q9H2S5 420 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.59□□□□□ -1.03
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