RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469241.2

PKD1-205, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 2

Gene PKD1, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-205ENST00000469241 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 SMOQ99835 787 aa21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.093e-13■■■■■ 167.7
PKD1-205ENST00000469241 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 IL37Q9NZH6 218 aa21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 SPTBN2O15020 2390 aa21.87■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 IRF1P10914 325 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 GRIA2P42262 883 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 LIMK1P53667 647 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CRY1Q16526 586 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ALLCQ8N6M5 410 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 C12orf29Q8N999 325 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 INVSQ9Y283 1065 aa21.86■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 FAM92AA1XBS5 289 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 TLR5O60602 858 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 BEST1O76090 585 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 TRIM49P0CI25 452 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 TRIM49CP0CI26 452 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 TIE1P35590 1138 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 GCLMP48507 274 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 NFIL3Q16649 462 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 RASSF3Q86WH2 238 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 C12orf40Q86WS4 652 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 JAKMIP2Q96AA8 810 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.85■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ANTXRLA6NF34 631 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ADRB1P08588 477 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 DPYDQ12882 1025 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ADAM9Q13443 819 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 ANO4Q32M45 955 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 EOGTQ5NDL2 527 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 RXFP3Q9NSD7 469 aa21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 A0A1W2PQ27 194 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 A0A1W2PQ64 194 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 A0A1W2PQD8 194 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CAVIN2O95810 425 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CD58P19256 250 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 TNFRSF4P43489 277 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 INCA1Q0VD86 236 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 MESP2Q0VG99 397 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 STPG1Q5TH74 334 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 NAT16Q8N8M0 369 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 DEC1Q9P2X7 70 aa21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PKD1-205ENST00000469241 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.83■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 SGK1O00141 431 aa21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 PPP3CAQ08209 521 aa21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 EMC10Q5UCC4 262 aa21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 PMS2CLQ68D20 193 aa21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 RNF43Q68DV7 783 aa21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 TMEM92Q6UXU6 159 aa21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 WHAMMQ8TF30 809 aa21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa21.82■■□□□ 1.08
PKD1-205ENST00000469241 TWNKQ96RR1 684 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms