RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460061.5

SPOCD1-204, Transcript of SPOC domain containing 1, human

TSL 2

Gene SPOCD1, Length 2,625 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPOCD1-204	ENST00000460061	DYNLT1	P63172	113 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	PPIL2	Q13356	520 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CENPU	Q71F23	418 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	MAML1	Q92585	1016 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SAR1A	Q9NR31	198 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	MAP3K7	O43318	606 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	LRCH4	O75427	683 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	C22orf31	O95567	290 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	MCF2	P10911	925 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ATIC	P31939	592 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	NR1H3	Q13133	447 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	GSTA3	Q16772	222 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CPXM1	Q96SM3	734 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ASB7	Q9H672	318 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CST8	O60676	142 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	INSRR	P14616	1297 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ETS2	P15036	469 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ORC1	Q13415	861 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	LSAMP	Q13449	338 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	TMED2	Q15363	201 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	KYAT1	Q16773	422 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061		A0A087WZ62	844 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	C2CD2L	O14523	706 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CCDC22	O60826	627 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	INHBC	P55103	352 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	PDK4	Q16654	411 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	LCA5	Q86VQ0	697 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	TMCO1	Q9UM00	188 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061		M0QYV0	167 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	CILP	O75339	1184 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	ERBB2	P04626	1255 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	FGFR1	P11362	822 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	KDELR1	P24390	212 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	IL1R2	P27930	398 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	EMC1	Q8N766	993 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SPOCD1-204	ENST00000460061	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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