RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 FGF13Q92913 245 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 NOX5Q96PH1 765 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 CYLDQ9NQC7 956 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIOO75962 3097 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 GYPCP04921 128 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 CFHP08603 1231 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 GJA1P17302 382 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 TKTL1P51854 596 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX16P57768 344 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM150AQ86TG1 271 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 ING5Q8WYH8 240 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 DOCK6Q96HP0 2047 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 MYADMQ96S97 322 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 TASP1Q9H6P5 420 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 EPS15L1Q9UBC2 864 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PROB1E7EW31 1015 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 MMEP08473 750 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 LAMP2P13473 410 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PFKLP17858 780 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL34P49207 117 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 RGS7P49802 495 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR158Q5T848 1215 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 MON1AQ86VX9 555 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SCML4Q8N228 414 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNK12Q9HB15 430 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 H0Y858 1186 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TADA3O75528 432 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO21O94952 628 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBED1O96006 694 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 LCP1P13796 627 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRNB2P17787 502 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CASP14P31944 242 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKCIP41743 596 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PSEN1P49768 467 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP4F8P98187 520 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ADIGQ0VDE8 80 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM110Q86TL2 294 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PASD1Q8IV76 773 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NXPE3Q969Y0 559 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 AGPAT1Q99943 283 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ST7Q9NRC1 585 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 GMIPQ9P107 970 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PATJQ8NI35 1801 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ABL1P00519 1130 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 USP17L7P0C7H9 530 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 WEE1P30291 646 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 FMO1Q01740 532 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCLQ13371 301 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TMC6Q7Z403 805 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 IRGQQ8WZA9 623 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 SART1O43290 800 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 GFRA3O60609 400 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 GABBR2O75899 941 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFAIP3P21580 790 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBP50607 506 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 HECTD3Q5T447 861 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 TXNDC8Q6A555 127 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 MTSS1LQ765P7 747 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGEF1-205ENST00000450873 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms