RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 POTEB3A0JP26 581 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FSCN2O14926 492 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAPC2Q13487 334 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFAIP1Q13829 316 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNIQ14094 377 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DLGAP5Q15398 846 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL2A1Q16548 175 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 POTEBQ6S5H4 581 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TDRPQ86YL5 185 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF169Q8NCN4 708 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf48Q96LL4 319 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BTBD9Q96Q07 612 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP85Q9BW27 656 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DCLK3Q9C098 648 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 THEGQ9P2T0 379 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJA2O60884 412 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFAIP8O95379 198 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPH10BP0C881 870 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 OCM2P0CE71 109 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KITP10721 976 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CPA3P15088 417 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CIITAP33076 1130 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP8P85298 464 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CNGA3Q16281 694 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SMUG1Q53HV7 270 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ANO5Q75V66 913 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KLRG1Q96E93 195 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CSRNP1Q96S65 589 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CCT7Q99832 543 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS11Q9H270 941 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CA12O43570 354 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PIP5K1CO60331 668 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BANF1O75531 89 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ACADVLP49748 655 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CD300CQ08708 224 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAIQ8N9R8 606 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FRS2Q8WU20 508 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MYPNQ86TC9 1320 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ITM2AO43736 263 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT38O76015 456 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CRTAMO95727 393 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBED1O96006 694 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FUCA1P04066 466 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CD48P09326 243 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2MP0CAP2 368 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM49P0CI25 452 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM49CP0CI26 452 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BCAP31P51572 246 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NR1H2P55055 460 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP4P98171 946 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CBWD6Q4V339 395 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms