RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF28PB7ZC32 967 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 E9PLN8 166 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PEX12O00623 359 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 FYB1O15117 783 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TULP3O75386 442 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 GJB3O75712 270 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PGM3O95394 542 aa5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 CLRN1P58418 232 aa5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 PTP4A2Q12974 167 aa5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 PCOLCEQ15113 449 aa5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 GAGE13Q4V321 117 aa5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 FITM2Q8N6M3 262 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR20Q99678 358 aa5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 SYT3Q9BQG1 590 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TAOK3Q9H2K8 898 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 RMI1Q9H9A7 625 aa5.12□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 GDAQ9Y2T3 454 aa5.12□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM64BA6NI03 449 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 DCLK1O15075 740 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 SRGAP2O75044 1071 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM23O75077 832 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS4BO75351 444 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 CER1O95813 267 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP21A2P08686 494 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 FBLN1P23142 703 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TM4SF1P30408 202 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCD1P33897 745 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMB10P40306 273 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 HADHAP40939 763 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
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CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM266Q2M3C6 531 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF569Q5MCW4 686 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP20A1Q6UW02 462 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MED25Q71SY5 747 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 IQCA1Q86XH1 822 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC105Q8IYK2 499 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 TTLL6Q8N841 843 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL10Q8N8L6 244 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 KYQ8NBH2 561 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PDPRQ8NCN5 879 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MSANTD4Q8NCY6 345 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 LINS1Q8NG48 757 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 ABHD4Q8TB40 342 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 PWWP2AQ96N64 755 aa5.11□□□□□ -1.59
CBX1P4-201ENST00000439415 EYA3Q99504 573 aa5.11□□□□□ -1.59
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