RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf27AQ580R0 203 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 FAM200BP0CF97 657 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GRIA2P42262 883 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SEC13P55735 322 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K7CLP57077 242 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf40Q86WS4 652 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf29Q8N999 325 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CYLDQ9NQC7 956 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 VPS45Q9NRW7 570 aa22.19■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 LAMA1P25391 3075 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TLR5O60602 858 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ADRB1P08588 477 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 KRT13P13646 458 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2H1P32780 548 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF4P43489 277 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A11P48066 632 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PPP3CAQ08209 521 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ORC1Q13415 861 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TWNKQ96RR1 684 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SCML2Q9UQR0 700 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 MYH10P35580 1976 aa22.18■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 HHLA1C9JL84 531 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CILPO75339 1184 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM49P0CI25 452 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM49CP0CI26 452 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GCLMP48507 274 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 MESP2Q0VG99 397 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PPM1JQ5JR12 505 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PMS2CLQ68D20 193 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 HTR3DQ70Z44 454 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 NACA2Q9H009 215 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.17■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GREM1O60565 184 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH1A2O94788 518 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF202O95125 648 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM9Q13443 819 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC6Q16204 474 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 EOGTQ5NDL2 527 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 IL31Q6EBC2 164 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ANO7Q6IWH7 933 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ALLCQ8N6M5 410 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.16■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ANTXRLA6NF34 631 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TM4SF5O14894 197 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 DCLK1O15075 740 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ADORA2BP29275 332 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 PGFP49763 221 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 KRT39Q6A163 491 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF276Q8N554 614 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TTC39CQ8N584 583 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 WHAMMQ8TF30 809 aa22.15■■□□□ 1.14
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