RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422847.1

LINC00857-201, long intergenic non-protein coding RNA 857, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00857, Length 2,161 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00857-201ENST00000422847 CPT1BQ92523 772 aa11.76□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TTC17Q96AE7 1141 aa11.76□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 EBF3Q9H4W6 596 aa11.76□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PARVAQ9NVD7 372 aa11.76□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.76□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CFBP00751 764 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 VAV1P15498 845 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 C1QTNF8P60827 252 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PTK7Q13308 1070 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 MYBPC3Q14896 1274 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 MSS51Q4VC12 460 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 C2CD6Q53TS8 623 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 RAPH1Q70E73 1250 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 SPATA24Q86W54 205 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PALM2Q8IXS6 379 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 FBXO27Q8NI29 283 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 HIC2Q96JB3 615 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TTC1Q99614 292 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 S100A14Q9HCY8 104 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 GINM1Q9NU53 330 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TBX20Q9UMR3 447 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 AP1G1O43747 822 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 AOC2O75106 756 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 BAG2O95816 211 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 ASLP04424 464 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 UQCRBP14927 111 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 MED21Q13503 144 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CFAP157Q5JU67 520 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 RFX8Q6ZV50 586 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 RASSF3Q86WH2 238 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 SERAC1Q96JX3 654 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 THTPAQ9BU02 230 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 E5RJQ4 531 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 OPHN1O60890 802 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 SPAG6O75602 509 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 USP1O94782 785 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TMCC1O94876 653 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 IFNB1P01574 187 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 SLC10A3P09131 477 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 RGS2P41220 211 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CDKN2BP42772 138 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PEX3P56589 373 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 GAD2Q05329 585 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 SNAPC2Q13487 334 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 ATG16L1Q676U5 607 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PDIK1LQ8N165 341 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CAPNS2Q96L46 248 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 BTBD19C9JJ37 291 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 ETS2P15036 469 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 HSD3B2P26439 372 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 GRIA2P42262 883 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 UBXN2AP68543 259 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CCL15Q16663 113 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 BRI3BPQ8WY22 251 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 JADE3Q92613 823 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 APBB2Q92870 758 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 KLHL4Q9C0H6 718 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00857-201ENST00000422847 MKS1Q9NXB0 559 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms