RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLAUP00749 431 aa-0.6□□□□□ -2.51
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V1B1P15313 513 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP5JP18859 108 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 YY1P25490 414 aa-0.6□□□□□ -2.51
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RNU6-172P-201ENST00000411000 FERD3LQ96RJ6 166 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 IWS1Q96ST2 819 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCNM1Q9BWG6 230 aa-0.6□□□□□ -2.51
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CYTL1Q9NRR1 136 aa-0.6□□□□□ -2.51
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RNU6-172P-201ENST00000411000 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP-0.6□□□□□ -2.51
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CDHR4A6H8M9 788 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMS2P5A8MQ11 134 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CDYLQ9Y232 598 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOXL2Q9Y4K0 774 aa-0.61□□□□□ -2.51
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