RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 DESP17661 470 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 GRM5P41594 1212 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FLT3LGP49771 235 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 NDST1P52848 882 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ARMCX2Q7L311 632 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ZNF410Q86VK4 478 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 DCAKDQ8WVC6 231 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CALN1Q9BXU9 219 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 YY1AP1Q9H869 796 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 EVPLQ92817 2033 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 KRT4P19013 534 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SSTR1P30872 391 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 MAGEA6P43360 314 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CDH6P55285 790 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ11Q14654 390 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SLC1A5Q15758 541 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 APBB2Q92870 758 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PEBP4Q96S96 227 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PPM1 405 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PDE4CQ08493 712 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC3Q13217 504 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PKDCCQ504Y2 493 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 C4orf33Q8N1A6 199 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 BANPQ8N9N5 519 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CYLDQ9NQC7 956 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 AKT3Q9Y243 479 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 TEX264Q9Y6I9 313 aa24.78■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 VGLL3A8MV65 326 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 GSTA2P09210 222 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ADCY1Q08828 1119 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PARP6Q2NL67 630 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 MDM4O15151 490 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN1O60635 241 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PFKMP08237 780 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SCNN1AP37088 669 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.567e-8■■■■□ 25.4
PMS1-205ENST00000409985 BBS9Q3SYG4 887 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ARCQ7LC44 396 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 TMEM110Q86TL2 294 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 USP29Q9HBJ7 922 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 GRID1Q9ULK0 1009 aa24.77■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CYP3A5P20815 502 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CDC42EP1Q00587 391 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ORC1Q13415 861 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TAF5Q15542 800 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 FAM47EQ6ZV65 393 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 UBA3Q8TBC4 463 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SLC44A1Q8WWI5 657 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 FAF2Q96CS3 445 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 LRRC39Q96DD0 335 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TMEM237Q96Q45 408 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 LRRC37BQ96QE4 947 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 KATNBL1Q9H079 304 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 SRRDQ9UH36 339 aa24.76■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 E5RJQ4 531 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 IL1BP01584 269 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 IGBP1P78318 339 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 GAD2Q05329 585 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 TRNP1Q6NT89 227 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 UNC93AQ86WB7 457 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CHSY1Q86X52 802 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 INPP5DQ92835 1189 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 CPB2Q96IY4 423 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 APBA2Q99767 749 aa24.75■■□□□ 1.55
PMS1-205ENST00000409985 ZNF670Q9BS34 389 aa24.75■■□□□ 1.55
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