RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 KIF1BO60333 1816 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TMEM191CA6NGB0 347 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CYP27B1O15528 508 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TTKP33981 857 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DGCR6Q14129 220 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 STK32CQ86UX6 486 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 MIER2Q8N344 545 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FITM2Q8N6M3 262 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 POC5Q8NA72 575 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAR2Q96K12 515 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 KCTD10Q9H3F6 313 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PCDH9Q9HC56 1237 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CROTQ9UKG9 612 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 KBTBD13C9JR72 458 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 HUS1O60921 280 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAM20BO75063 409 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 LDLRP01130 860 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GPD1P21695 349 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ARPP19P56211 112 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 EPHB6O15197 1021 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GRM1Q13255 1194 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SPIDRQ14159 915 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GADL1Q6ZQY3 521 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 IPMKQ8NFU5 416 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PSMA8Q8TAA3 256 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 MPP6Q9NZW5 540 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 BTBD3Q9Y2F9 522 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SLCO1B7G3V0H7 640 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CDK7P50613 346 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PTK6Q13882 451 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PCSK7Q16549 785 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 C4orf22Q6V702 233 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 NIM1KQ8IY84 436 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CD274Q9NZQ7 290 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.1□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TBX3O15119 743 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 STX7O15400 261 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TRMUO75648 421 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 BAIAP3O94812 1187 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CCNFP41002 786 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TNFAIP2Q03169 654 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ZNF543Q08ER8 600 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PDK1Q15118 436 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ENKURQ8TC29 256 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 OSCP1Q8WVF1 389 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PIGBQ92521 554 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 HES6Q96HZ4 224 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 BDH2Q9BUT1 245 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CHST12Q9NRB3 414 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ATP8B3O60423 1300 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAM205AQ6ZU69 1335 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 MRASO14807 208 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GSC2O15499 205 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TOMM70O94826 608 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CYP51A1Q16850 503 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DUPD1Q68J44 220 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 OTOAQ7RTW8 1153 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 UBA3Q8TBC4 463 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 UCMAQ8WVF2 138 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DLG3Q92796 817 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RMDN1Q96DB5 314 aa10.09□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms