RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363269.1

RNU6-778P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 778, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-778P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-778P-201ENST00000363269 TAP2Q03519 686 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 EFR3AQ14156 821 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 KRT32Q14532 448 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 KCTD2Q14681 263 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 GEN1Q17RS7 908 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 GALNTL6Q49A17 601 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TTC22Q5TAA0 569 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ATG16L1Q676U5 607 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 HAUS3Q68CZ6 603 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ANKRD40Q6AI12 368 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SLC9A4Q6AI14 798 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 DSTYKQ6XUX3 929 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 Q6ZRM9 215 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 P3H2Q8IVL5 708 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ABRAQ8N0Z2 381 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ST8SIA4Q92187 359 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FAM136AQ96C01 138 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TWNKQ96RR1 684 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 HAPLN3Q96S86 360 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 GPR20Q99678 358 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TTPALQ9BTX7 342 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 MECRQ9BV79 373 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 RMI1Q9H9A7 625 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 BAG5Q9UL15 447 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 A0A1W2PPH5 198 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FAM90A18PA6NE21 464 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FAM90A16PA6NEW6 464 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 DIRC3C9JPN6 131 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 PSMD9O00233 223 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 CYP27B1O15528 508 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 KLK10O43240 276 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FIBPO43427 364 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ZFPL1O95159 310 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ELANEP08246 267 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FAM90A15PP0C7V4 464 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TMEM225BP0DP42 221 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 PEPDP12955 493 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 CD19P15391 556 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 GATA3P23771 443 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 PGM1P36871 562 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 PBX1P40424 430 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SCNN1GP51170 649 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 RABGGTBP53611 331 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 CASP6P55212 293 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 CXADRP78310 365 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 FHL3Q13643 280 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ZNF124Q15973 351 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 LRRC24Q50LG9 513 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 GLB1LQ6UWU2 654 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 POLNQ7Z5Q5 900 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TRABD2AQ86V40 505 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 CHD1LQ86WJ1 897 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 Q8N3U1 123 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-778P-201ENST00000363269 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms