RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTC26A0AVF1 554 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 WASH4PA8MWX3 477 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 LACTBL1A8MY62 500 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TADA2AO75478 443 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF202O95125 648 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLTAP09496 248 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNA5P22460 613 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SOX9P48436 509 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACOT2P49753 483 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNQ1P51787 676 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLCNKBP51801 687 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPAG1Q07617 926 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 DUSP4Q13115 394 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALCAMQ13740 583 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTPN14Q15678 1187 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 KYAT1Q16773 422 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 UPP1Q16831 310 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 FUT10Q6P4F1 479 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 OXR1Q8N573 874 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHST7Q9NS84 486 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLEC1BQ9P126 229 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 STK39Q9UEW8 545 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 IRAK3Q9Y616 596 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 C5orf42Q9H799 3197 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 MUC3AQ02505 3323 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYO7AQ13402 2215 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANK1P16157 1881 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SHISA3A0PJX4 238 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TGFB1I1O43294 461 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 B3GAT3O94766 335 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYL1P05976 194 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLI1P08151 1106 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CA8P35219 290 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 DSG1Q02413 1049 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 POSTNQ15063 836 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZBTB6Q15916 424 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 B3GALT6Q96L58 329 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 UROC1Q96N76 676 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 HDAC8Q9BY41 377 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM206Q9H813 350 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPT2Q9UMR5 302 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBE4BO95155 1302 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 VWA8A3KMH1 1905 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 FSD2A1L4K1 749 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PODXLO00592 558 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SIGLEC6O43699 453 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 URODP06132 367 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRPAP1P30533 357 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 BRCC3P46736 316 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLUD2P49448 558 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDUFV1P49821 464 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 GUCY2FP51841 1108 aa8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms