RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 APRTP07741 180 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 HSF2Q03933 536 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 LGALS3BPQ08380 585 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 DUOXA2Q1HG44 320 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF284Q2VY69 593 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 MROH9Q5TGP6 573 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TTC23Q5W5X9 447 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 HEY2Q9UBP5 337 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 HPCAL1P37235 193 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 NFYCQ13952 458 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 NGLY1Q96IV0 654 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 MND1Q9BWT6 205 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 HPS4Q9NQG7 708 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 C3orf18Q9UK00 162 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 FLT1P17948 1338 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 SDR42E2A6NKP2 422 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 PNPLA4P41247 253 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 GCLMP48507 274 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 TUBB3Q13509 450 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 SEC31BQ9NQW1 1179 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 GIN1Q9NXP7 522 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ADAM28Q9UKQ2 775 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 USP6P35125 1406 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 C2orf81A6NN90 581 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 RIMBP2O15034 1052 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 SLC22A2O15244 555 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 UQCRBP14927 111 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 EFR3AQ14156 821 aa5.68□□□□□ -1.5
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