RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331559.9

MEIS3-201, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 2,104 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-201ENST00000331559 RBP3P10745 1247 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 ACADSBP45954 432 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 GDF10P55107 478 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 ARCQ7LC44 396 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 APPL2Q8NEU8 664 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 SPATA18Q8TC71 538 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 MAGEB18Q96M61 343 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 IPPQ9Y573 584 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 KPNA6O60684 536 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 PSMC4P43686 418 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 ROR1Q01973 937 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 NR1H3Q13133 447 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 HIF1AQ16665 826 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 CGB2Q6NT52 195 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 TDRPQ86YL5 185 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 RNF157Q96PX1 679 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 KLK14Q9P0G3 267 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 GJD2Q9UKL4 321 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 ZNF487B1APH4 448 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 MDM4O15151 490 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 AKR1A1P14550 325 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 PTPN9P43378 593 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 ARL4CP56559 192 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 ATP11AP98196 1134 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 GALNTL6Q49A17 601 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 CPT1BQ92523 772 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS3-201ENST00000331559 TGM2P21980 687 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 INHBEP58166 350 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 UNC45BQ8IWX7 931 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 TNIP3Q96KP6 325 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 PRKAG3Q9UGI9 489 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 FOXN2P32314 431 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 MMRN1Q13201 1228 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 IFNL1Q8IU54 200 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 ZBED8Q8IZ13 594 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 HSFY1Q96LI6 401 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 RNF39Q9H2S5 420 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 SPTLC1O15269 473 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 HUS1O60921 280 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 FGFR1P11362 822 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 TAC1P20366 129 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 WDR4P57081 412 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 TRABD2AQ86V40 505 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 ZNF670Q9BS34 389 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 PDGFRBP09619 1106 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 FAM163BP0C2L3 166 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 CCDC130P13994 396 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 ADORA2BP29275 332 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 LRPAP1P30533 357 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 NCALDP61601 193 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 CFAP69A5D8W1 941 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 CFAP73A6NFT4 308 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 M0QZ92 97 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 APOL1O14791 398 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 SPAG7O75391 227 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 GABBR2O75899 941 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 PHBP35232 272 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 RAB6CQ53S08 254 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 ECT2Q9H8V3 914 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-201ENST00000331559 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms