RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 CCDC157Q569K6 752 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 IPMKQ8NFU5 416 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ARL8AQ96BM9 186 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 KLRG1Q96E93 195 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ADGRB2O60241 1585 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CTNNB1P35222 781 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 SOX10P56693 466 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 NAB2Q15742 525 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 UNC45BQ8IWX7 931 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 FIBCD1Q8N539 461 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 NCLNQ969V3 563 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 MTBPQ96DY7 904 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 KITP10721 976 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 FLT3LGP49771 235 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 PLIN5Q00G26 463 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 UGP2Q16851 508 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 BOLA3Q53S33 107 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CCDC103Q8IW40 242 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CALML6Q8TD86 181 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 KLK7P49862 253 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 MTA1Q13330 715 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 EPC2Q52LR7 807 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 PTPRN2Q92932 1015 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 SENP1Q9P0U3 644 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 RHOCP08134 193 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 GRK4P32298 578 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CCL23P55773 120 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 PACS2Q86VP3 889 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 LONP2Q86WA8 852 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CIPCQ9C0C6 399 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ISCUQ9H1K1 167 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CRLS1Q9UJA2 301 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 FAM50BQ9Y247 325 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 NFASCO94856 1347 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 APRTP07741 180 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 RGS4P49798 205 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 PAK5Q9P286 719 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 VPS28Q9UK41 221 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 A0A1W2PQJ5 194 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ACKR2O00590 384 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ADCY6O43306 1168 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 LONRF1Q17RB8 773 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 C4orf22Q6V702 233 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 UROC1Q96N76 676 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 FOXP2O15409 715 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 ANXA9O76027 345 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 TMEM253P0C7T8 217 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 RUNX1T1Q06455 604 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CRYMQ14894 314 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.25□□□□□ -0.61
URB2-201ENST00000258243 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms