RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 HOXB2P14652 356 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TNNC1P63316 161 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 FAM193AP78312 1265 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF33AQ06730 810 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 DEFB119Q8N690 84 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CGRRF1Q99675 332 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 PANK2Q9BZ23 570 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 A0A1W2PQF6 199 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 NTSR1P30989 418 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TUBP50607 506 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 HECTD3Q5T447 861 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 MIB1Q86YT6 1006 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 HPS3Q969F9 1004 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 KCNK16Q96T55 309 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CD248Q9HCU0 757 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 A8MXQ7 604 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 ARHGAP33O14559 1287 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TRIM24O15164 1050 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CAPNS1P04632 268 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CD59P13987 128 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TNNI1P19237 187 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 PSMD6Q15008 389 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 ANO4Q32M45 955 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TMEM25Q86YD3 366 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 WBP2Q969T9 261 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 IL37Q9NZH6 218 aa20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 ATP8B3O60423 1300 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 A0A1W2PQD8 194 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 FAM92AA1XBS5 289 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 TAF4O00268 1085 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF217O75362 1048 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 NDUFV2P19404 249 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 WASP42768 502 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 SLC5A3P53794 718 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 CYP24A1Q07973 514 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 FAM35AQ86V20 835 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 PROSER1Q86XN7 944 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 RDH13Q8NBN7 331 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.14■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 TGFB1I1O43294 461 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 SYPP08247 313 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 MYL6P60660 151 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 PDILTQ8N807 584 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF516Q92618 1163 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 ACOX2Q99424 681 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 TNMDQ9H2S6 317 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 GMIPQ9P107 970 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.13■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 GREM1O60565 184 aa20.12■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 GJB3O75712 270 aa20.12■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 IRF1P10914 325 aa20.12■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 PDCP20941 246 aa20.12■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 ATICP31939 592 aa20.12■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 SLC14A1Q13336 389 aa20.12■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 TRPC3Q13507 836 aa20.12■□□□□ 0.81
SLX1A-201ENST00000251303 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms