RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM71AQ8IYT1 594 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-201ENST00000246533 XXYLT1Q8NBI6 393 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-201ENST00000246533 DYDC1Q8WWB3 177 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-201ENST00000246533 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-201ENST00000246533 SPOPO43791 374 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNTL6Q49A17 601 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHO2Q8TD55 490 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 GRK7Q8WTQ7 553 aa27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 I3L4J1 428 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 FSCN2O14926 492 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1AP35813 382 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM23A6NLE4 172 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GAT3O94766 335 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 RARAP10276 462 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 PPARDQ03181 441 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP128Q6ZU80 1094 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS52Q8N1B4 723 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 GRAMD1AQ96CP6 724 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 BATF3Q9NR55 127 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa27.56■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM132DQ14C87 1099 aa27.55■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 EPS8L1Q8TE68 723 aa27.55■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 TLR9Q9NR96 1032 aa27.55■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa27.55■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 TADA2AO75478 443 aa27.54■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 COPS2P61201 443 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP24A1Q07973 514 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-201ENST00000246533 PTK6Q13882 451 aa27.53■■■□□ 2
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CAPNS1-201ENST00000246533 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP27.51■■■□□ 2
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