RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 USP6NLQ92738 828 aa21.61■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 OTUD5Q96G74 571 aa21.61■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.61■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.61■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 DPP3Q9NY33 737 aa21.61■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.61■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.61■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PIK3R2O00459 728 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 APOL1O14791 398 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 TGDSO95455 350 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ETV4P43268 484 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 CCNG1P51959 295 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 OVGP1Q12889 678 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 DLK2Q6UY11 383 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ELP3Q9H9T3 547 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PFKMP08237 780 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PYGBP11216 843 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 NEFHP12036 1026 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 IL4RP24394 825 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 BCAR1P56945 870 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 FAM13CQ8NE31 585 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PTPRN2Q92932 1015 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ACAP3Q96P50 834 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 AKT3Q9Y243 479 aa21.6■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 AVILO75366 819 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 GRAP2O75791 330 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 DESP17661 470 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 SLC8A3P57103 927 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 LRRC6Q86X45 466 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ERO1BQ86YB8 467 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 CFAP36Q96G28 342 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 TBCBQ99426 244 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 KLC2Q9H0B6 622 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 TLE6Q9H808 572 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 FAM155BO75949 473 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ZBED1O96006 694 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ARFIP2P53365 341 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 WASHC2DQ5SRD0 308 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 LGSNQ5TDP6 509 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 C4orf22Q6V702 233 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.59■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 A0A0G2JND7 137 aa21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 IL1BP01584 269 aa21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 RBL1P28749 1068 aa21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 MAGEA6P43360 314 aa21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PQLC3Q8N755 202 aa21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 HEY2Q9UBP5 337 aa21.58■■□□□ 1.05
STRADB-201ENST00000194530 EVPLQ92817 2033 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 ASB14A6NK59 587 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 KRT37O76014 449 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 OSBPP22059 807 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 RGS7P49802 495 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 LAMC2Q13753 1193 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 AFG1LQ8WV93 481 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 APBB2Q92870 758 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 TTC17Q96AE7 1141 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 MROH8Q9H579 483 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.58■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 E7ENQ6 273 aa21.57■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 COPEO14579 308 aa21.57■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 DNAJC6O75061 913 aa21.57■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 GSTA2P09210 222 aa21.57■■□□□ 1.04
STRADB-201ENST00000194530 CALB2P22676 271 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms