RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mmp13P33435 472 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dynlt1P51807 113 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CtswP56203 371 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dlg3P70175 849 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptprn2P80560 1001 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbtb14Q08376 449 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kansl1lQ5DTI6 991 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim38Q5SZ99 471 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q5XFZ0 217 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrgprb8Q7TN51 330 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 C2cd2lQ80X80 706 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdkn3Q810P3 211 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q810S2 196 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arhgef33Q8BW86 850 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wdr27Q8C5V5 780 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cplx3Q8R1B5 158 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TfQ921I1 697 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrfap1Q9CQL7 125 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Micu3Q9CTY5 523 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nme7Q9QXL8 395 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Magel2Q9QZ04 1284 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plxnb3Q9QY40 1902 aa10.65□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc16a6B1AT66 607 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10720D3Z1I5 223 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim55G3X8Y1 545 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Anxa8O35640 327 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mcpt4P21812 246 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PorP37040 678 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ndst1Q3UHN9 882 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr162Q3UN16 588 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PkdccQ5RJI4 492 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myo6Q64331 1265 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1105Q7TR58 312 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Got1l1Q7TSV6 404 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q8CCC3 530 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spag16Q8K450 639 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Timd2Q8R183 305 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hkdc1Q91W97 915 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Golga1Q9CW79 758 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnq4Q9JK97 696 aa10.65□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm281D3Z1Y0 860 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Daw1D3Z7A5 415 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm6205E9PZS2 359 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc27a2O35488 620 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NoctO35710 429 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PostnQ62009 838 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nlrp4fQ66X05 959 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rad54bQ6PFE3 886 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cep104Q80V31 926 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hspbap1Q8BK58 483 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm6367Q8C6L9 287 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam160b1Q8CDM8 764 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slf1Q8R3P9 1054 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf112Q96DY5 654 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abcg8Q9DBM0 673 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NagaQ9QWR8 415 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tubd1Q9R1K7 455 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbtb12Q9Z150 459 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arih2Q9Z1K6 492 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nup62clA2AG10 272 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd16A2AS55 361 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Proca1B0QZF7 307 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 C87414E9PWI7 475 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpinb6eI7HJI3 429 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm7694J3QNH8 270 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Serpinb9O08797 374 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r1O70410 912 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TnfP06804 235 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fscn2Q32M02 492 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stt3bQ3TDQ1 823 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trmt1Q3TX08 663 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc38a5Q3U1J0 479 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc5a10Q5SWY8 596 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Has1Q61647 583 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CochQ62507 552 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxl13Q8CDU4 790 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf276Q8CE64 614 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abcf3Q8K268 709 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q8VDP2 222 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MrgpreQ91ZB7 310 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NamptQ99KQ4 491 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SncaipQ99ME3 962 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ogfod2Q9CQ04 349 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spc24Q9D083 201 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpihbp1Q9D1N2 228 aa10.64□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scgb2b21A0A087WQA9 112 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lonrf2B2RT44 518 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.2 ms