RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636566.1

EFHC1-222, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-222	ENST00000636566	UNC13B	O14795	1591 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ATP7A	Q04656	1500 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	POTEF	A5A3E0	1075 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	NEFM	P07197	916 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ARID3A	Q99856	593 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	GGT6	Q6P531	493 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	KIF12	Q96FN5	646 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	USP47	Q96K76	1375 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	CCDC7	Q96M83	1385 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	IGSF3	O75054	1194 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	TMEM51	Q9NW97	253 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	MMP14	P50281	582 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	TIE1	P35590	1138 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	A2M	P01023	1474 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	CLGN	O14967	610 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	CLSTN1	O94985	981 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	RAPGEF3	O95398	923 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	GSE1	Q14687	1217 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	TRPC6	Q9Y210	931 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	NEO1	Q92859	1461 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFHC1-222	ENST00000636566	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	TET3	O43151	1660 aa		7.21	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	ATP10A	O60312	1499 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	PLA2R1	Q13018	1463 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	MAP3K13	O43283	966 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	SEC24B	O95487	1268 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	MCC	P23508	829 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	TMF1	P82094	1093 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	KDM5C	P41229	1560 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		7.2	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566		E9PCH4	1651 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	ZNF592	Q92610	1267 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	TRPM2	O94759	1503 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	TPM2	P07951	284 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	FAM193A	P78312	1265 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	IER5L	Q5T953	404 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	DEPDC5	O75140	1603 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	PTPRT	O14522	1441 aa		7.18	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	GLI2	P10070	1586 aa		7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	CDCA8	Q53HL2	280 aa		7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	RASEF	Q8IZ41	740 aa		7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
EFHC1-222	ENST00000636566	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms