RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628837.2

PCBP1-AS1-334, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 866 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NUP155O75694 1391 aa11.89□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.88□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 UNC13BO14795 1591 aa11.88□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.88□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ATRNO75882 1429 aa11.87□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 METP08581 1390 aa11.87□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.85□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.85□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 E9PCH4 1651 aa11.84□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 LAMC1P11047 1609 aa11.83□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 HFM1A2PYH4 1435 aa11.83□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.83□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.82□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.82□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.82□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ORAI2Q96SN7 254 aa11.82□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 RNF39Q9H2S5 420 aa11.82□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.8□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.79□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 MYOM2P54296 1465 aa11.79□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 BAG6P46379 1132 aa11.79□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.78□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 FOXO3O43524 673 aa11.77□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 PSME1Q06323 249 aa11.77□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 POTEDQ86YR6 584 aa11.77□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.77□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.77□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 VPS72Q15906 364 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 LRP5O75197 1615 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.73□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.73□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.72□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SLIT2O94813 1529 aa11.72□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 PXDNQ92626 1479 aa11.72□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 A0A0G2JS52 829 aa11.72□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 CAPN15O75808 1086 aa11.72□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ITGAEP38570 1179 aa11.72□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 MYT1Q01538 1121 aa11.72□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 HRCP23327 699 aa11.71□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ARHGEF10O15013 1369 aa11.7□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 KIF1BO60333 1816 aa11.7□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.7□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 EP400Q96L91 3159 aa11.69□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NAIPQ13075 1403 aa11.69□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SIRT1Q96EB6 747 aa11.68□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 CLTCL1P53675 1640 aa11.67□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SBNO1A3KN83 1393 aa11.67□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ABCC11Q96J66 1382 aa11.67□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.67□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 POLA2Q14181 598 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 STK26Q9P289 416 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 TECPR2O15040 1411 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 GLI3P10071 1580 aa11.66□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 KIF1AQ12756 1690 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NUTM2FA1L443 756 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.65□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 USP32Q8NFA0 1604 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.64□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 YY1P25490 414 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NBPF14Q5TI25 921 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.63□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.62□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 DISP2A7MBM2 1401 aa11.61□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 FAM83GA6ND36 823 aa11.61□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.61□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-334ENST00000628837 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms