RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOM2P54296 1465 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-216ENST00000628306 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-216ENST00000628306 PXDNQ92626 1479 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXD1Q16676 465 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-216ENST00000628306 EP400Q96L91 3159 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ATRNO75882 1429 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TECPR2O15040 1411 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-216ENST00000628306 USP21Q9UK80 565 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT172Q9UG01 1749 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-216ENST00000628306 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXO3O43524 673 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC11Q96J66 1382 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.82■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.82■■■■□ 3.33
CAPNS1-216ENST00000628306 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-216ENST00000628306 STK26Q9P289 416 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3C2GO75747 1445 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RGL3Q3MIN7 710 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-216ENST00000628306 NUTM2FA1L443 756 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-216ENST00000628306 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-216ENST00000628306 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SLIT2O94813 1529 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF1AQ12756 1690 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-216ENST00000628306 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-216ENST00000628306 GLI3P10071 1580 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-216ENST00000628306 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRT1Q96EB6 747 aa35.64■■■■□ 3.3
CAPNS1-216ENST00000628306 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-216ENST00000628306 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-216ENST00000628306 USP32Q8NFA0 1604 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC125Q86Z20 511 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-216ENST00000628306 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA3Q99758 1704 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SBNO1A3KN83 1393 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DLC1Q96QB1 1528 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAM1Q96QH2 718 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-216ENST00000628306 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS72Q15906 364 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRB1O14514 1584 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRB2O60241 1585 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PSME1Q06323 249 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF10O15013 1369 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM83GA6ND36 823 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-216ENST00000628306 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHG5O94827 1062 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NRAPQ86VF7 1730 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-216ENST00000628306 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ALS2Q96Q42 1657 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-216ENST00000628306 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-216ENST00000628306 POGKQ9P215 609 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-216ENST00000628306 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT27Q7Z3Y8 459 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CAPNS1-216ENST00000628306 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-216ENST00000628306 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.22
CAPNS1-216ENST00000628306 BTG4Q9NY30 223 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-216ENST00000628306 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-216ENST00000628306 HRCP23327 699 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.16■■■■□ 3.22
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