RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628044.1

PFKL-212, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PFKL, Length 129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-212ENST00000628044 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.26■■■□□ 2.43
PFKL-212ENST00000628044 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.26■■■□□ 2.43
PFKL-212ENST00000628044 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.25■■■□□ 2.43
PFKL-212ENST00000628044 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
PFKL-212ENST00000628044 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.24■■■□□ 2.43
PFKL-212ENST00000628044 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
PFKL-212ENST00000628044 MYOM2P54296 1465 aa30.23■■■□□ 2.43
PFKL-212ENST00000628044 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
PFKL-212ENST00000628044 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.19■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 HRCP23327 699 aa30.19■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.19■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 LAMC1P11047 1609 aa30.18■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.18■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.18■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 C8orf37Q96NL8 207 aa30.18■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 AFF2P51816 1311 aa30.18■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 NUTM2FA1L443 756 aa30.17■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.16■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 SIRT1Q96EB6 747 aa30.16■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 RXRBP28702 533 aa30.15■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 ADAMTS2O95450 1211 aa30.14■■■□□ 2.42
PFKL-212ENST00000628044 FOXO3O43524 673 aa30.12■■■□□ 2.41
PFKL-212ENST00000628044 NGLY1Q96IV0 654 aa30.11■■■□□ 2.41
PFKL-212ENST00000628044 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.09■■■□□ 2.41
PFKL-212ENST00000628044 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
PFKL-212ENST00000628044 PRAM1Q96QH2 718 aa30.08■■■□□ 2.41
PFKL-212ENST00000628044 POGKQ9P215 609 aa30.08■■■□□ 2.41
PFKL-212ENST00000628044 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.08■■■□□ 2.41
PFKL-212ENST00000628044 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
PFKL-212ENST00000628044 STAC3Q96MF2 364 aa30.06■■■□□ 2.4
PFKL-212ENST00000628044 PXDNQ92626 1479 aa30.06■■■□□ 2.4
PFKL-212ENST00000628044 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PFKL-212ENST00000628044 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.02■■■□□ 2.4
PFKL-212ENST00000628044 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
PFKL-212ENST00000628044 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 DLC1Q96QB1 1528 aa30■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.99■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 USP21Q9UK80 565 aa29.98■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.98■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 KIF1AQ12756 1690 aa29.98■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 ADGRB1O14514 1584 aa29.97■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.96■■■□□ 2.39
PFKL-212ENST00000628044 PSME1Q06323 249 aa29.94■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.94■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.9■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
PFKL-212ENST00000628044 RGS12O14924 1447 aa29.88■■■□□ 2.37
PFKL-212ENST00000628044 ADGRB2O60241 1585 aa29.87■■■□□ 2.37
PFKL-212ENST00000628044 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PFKL-212ENST00000628044 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.86■■■□□ 2.37
PFKL-212ENST00000628044 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.85■■■□□ 2.37
PFKL-212ENST00000628044 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.85■■■□□ 2.37
PFKL-212ENST00000628044 SBNO1A3KN83 1393 aa29.83■■■□□ 2.37
PFKL-212ENST00000628044 ARHGEF10O15013 1369 aa29.82■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 ATRNO75882 1429 aa29.81■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.8■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.79■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 PLEKHG5O94827 1062 aa29.79■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.78■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 USP32Q8NFA0 1604 aa29.77■■■□□ 2.36
PFKL-212ENST00000628044 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.76■■■□□ 2.35
PFKL-212ENST00000628044 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.75■■■□□ 2.35
PFKL-212ENST00000628044 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.75■■■□□ 2.35
PFKL-212ENST00000628044 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
PFKL-212ENST00000628044 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
PFKL-212ENST00000628044 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.74■■■□□ 2.35
PFKL-212ENST00000628044 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PFKL-212ENST00000628044 SLIT2O94813 1529 aa29.71■■■□□ 2.35
PFKL-212ENST00000628044 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
PFKL-212ENST00000628044 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
PFKL-212ENST00000628044 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
PFKL-212ENST00000628044 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.67■■■□□ 2.34
PFKL-212ENST00000628044 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.66■■■□□ 2.34
PFKL-212ENST00000628044 CDK19Q9BWU1 502 aa29.66■■■□□ 2.34
PFKL-212ENST00000628044 ATP7BP35670 1465 aa29.64■■■□□ 2.34
PFKL-212ENST00000628044 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
PFKL-212ENST00000628044 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.63■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 VPS72Q15906 364 aa29.61■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.61■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 FAM83GA6ND36 823 aa29.59■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.59■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 ITSN1Q15811 1721 aa29.59■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 ABCA3Q99758 1704 aa29.58■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PFKL-212ENST00000628044 EP400Q96L91 3159 aa29.57■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 NEUROD1Q13562 356 aa29.56■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.56■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 ALS2Q96Q42 1657 aa29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms