RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621817.1

FAM58A-209, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, humanhuman

TSL 3

Gene FAM58A, Length 916 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58A-209ENST00000621817 STK26Q9P289 416 aa42.73■■■■■ 4.43
FAM58A-209ENST00000621817 ORAI2Q96SN7 254 aa42.71■■■■■ 4.43
FAM58A-209ENST00000621817 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
FAM58A-209ENST00000621817 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa42.69■■■■■ 4.42
FAM58A-209ENST00000621817 WAPLQ7Z5K2 1190 aa42.69■■■■■ 4.42
FAM58A-209ENST00000621817 PNPLA6Q8IY17 1366 aa42.66■■■■■ 4.42
FAM58A-209ENST00000621817 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
FAM58A-209ENST00000621817 CFAP70Q5T0N1 1121 aa42.64■■■■■ 4.42
FAM58A-209ENST00000621817 SIRT1Q96EB6 747 aa42.64■■■■■ 4.42
FAM58A-209ENST00000621817 FMN2Q9NZ56 1722 aa42.63■■■■■ 4.41
FAM58A-209ENST00000621817 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
FAM58A-209ENST00000621817 ADGRB1O14514 1584 aa42.59■■■■■ 4.41
FAM58A-209ENST00000621817 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
FAM58A-209ENST00000621817 DLC1Q96QB1 1528 aa42.56■■■■■ 4.4
FAM58A-209ENST00000621817 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
FAM58A-209ENST00000621817 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
FAM58A-209ENST00000621817 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
FAM58A-209ENST00000621817 PXDNQ92626 1479 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM58A-209ENST00000621817 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
FAM58A-209ENST00000621817 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
FAM58A-209ENST00000621817 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.5■■■■■ 4.39
FAM58A-209ENST00000621817 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.47■■■■■ 4.39
FAM58A-209ENST00000621817 STAC3Q96MF2 364 aa42.46■■■■■ 4.39
FAM58A-209ENST00000621817 KIF1AQ12756 1690 aa42.45■■■■■ 4.39
FAM58A-209ENST00000621817 DCAF11Q8TEB1 546 aa42.44■■■■■ 4.38
FAM58A-209ENST00000621817 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
FAM58A-209ENST00000621817 NUTM2FA1L443 756 aa42.42■■■■■ 4.38
FAM58A-209ENST00000621817 ADGRB2O60241 1585 aa42.41■■■■■ 4.38
FAM58A-209ENST00000621817 PRAM1Q96QH2 718 aa42.41■■■■■ 4.38
FAM58A-209ENST00000621817 AFF2P51816 1311 aa42.41■■■■■ 4.38
FAM58A-209ENST00000621817 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa42.4■■■■■ 4.38
FAM58A-209ENST00000621817 FOXO3O43524 673 aa42.38■■■■■ 4.37
FAM58A-209ENST00000621817 USP32Q8NFA0 1604 aa42.33■■■■■ 4.37
FAM58A-209ENST00000621817 C8orf37Q96NL8 207 aa42.32■■■■■ 4.37
FAM58A-209ENST00000621817 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 ADAMTS2O95450 1211 aa42.28■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 POGKQ9P215 609 aa42.28■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 TRAK1Q9UPV9 953 aa42.28■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 ANKARQ7Z5J8 1434 aa42.27■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa42.26■■■■■ 4.36
FAM58A-209ENST00000621817 RXRBP28702 533 aa42.25■■■■■ 4.35
FAM58A-209ENST00000621817 PHF8Q9UPP1 1060 aa42.22■■■■■ 4.35
FAM58A-209ENST00000621817 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa42.21■■■■■ 4.35
FAM58A-209ENST00000621817 NGLY1Q96IV0 654 aa42.2■■■■■ 4.35
FAM58A-209ENST00000621817 KRT28Q7Z3Y7 464 aa42.17■■■■■ 4.34
FAM58A-209ENST00000621817 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
FAM58A-209ENST00000621817 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
FAM58A-209ENST00000621817 TULP4Q9NRJ4 1543 aa42.15■■■■■ 4.34
FAM58A-209ENST00000621817 TNS3Q68CZ2 1445 aa42.13■■■■■ 4.34
FAM58A-209ENST00000621817 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 PRR36Q9H6K5 1346 aa42.11■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 SBNO1A3KN83 1393 aa42.11■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 RGS12O14924 1447 aa42.11■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 WASLO00401 505 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 USP21Q9UK80 565 aa42.08■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 ATRNO75882 1429 aa42.07■■■■■ 4.33
FAM58A-209ENST00000621817 PSME1Q06323 249 aa42.06■■■■■ 4.32
FAM58A-209ENST00000621817 ABCA3Q99758 1704 aa42.06■■■■■ 4.32
FAM58A-209ENST00000621817 BCL9LQ86UU0 1499 aa42.05■■■■■ 4.32
FAM58A-209ENST00000621817 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
FAM58A-209ENST00000621817 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa42.03■■■■■ 4.32
FAM58A-209ENST00000621817 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
FAM58A-209ENST00000621817 ATP7BP35670 1465 aa42■■■■■ 4.31
FAM58A-209ENST00000621817 ITSN1Q15811 1721 aa42■■■■■ 4.31
FAM58A-209ENST00000621817 ALS2Q96Q42 1657 aa41.99■■■■■ 4.31
FAM58A-209ENST00000621817 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.98■■■■■ 4.31
FAM58A-209ENST00000621817 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.98■■■■■ 4.31
FAM58A-209ENST00000621817 SLIT2O94813 1529 aa41.98■■■■■ 4.31
FAM58A-209ENST00000621817 ARHGEF10O15013 1369 aa41.98■■■■■ 4.31
FAM58A-209ENST00000621817 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa41.93■■■■■ 4.3
FAM58A-209ENST00000621817 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.92■■■■■ 4.3
FAM58A-209ENST00000621817 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.89■■■■■ 4.3
FAM58A-209ENST00000621817 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.89■■■■■ 4.3
FAM58A-209ENST00000621817 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.88■■■■■ 4.3
FAM58A-209ENST00000621817 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.87■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.86■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.86■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.86■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 CDK19Q9BWU1 502 aa41.84■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.83■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.83■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 GLI3P10071 1580 aa41.82■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 EP400Q96L91 3159 aa41.82■■■■■ 4.29
FAM58A-209ENST00000621817 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
FAM58A-209ENST00000621817 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
FAM58A-209ENST00000621817 QRICH2Q9H0J4 1663 aa41.8■■■■■ 4.28
FAM58A-209ENST00000621817 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
FAM58A-209ENST00000621817 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
FAM58A-209ENST00000621817 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.77■■■■■ 4.28
FAM58A-209ENST00000621817 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
FAM58A-209ENST00000621817 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.73■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms