RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa42.3■■■■■ 4.36
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
SEMA3B-215ENST00000621029 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
SEMA3B-215ENST00000621029 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
SEMA3B-215ENST00000621029 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
SEMA3B-215ENST00000621029 LAMC1P11047 1609 aa42.27■■■■■ 4.36
SEMA3B-215ENST00000621029 NUTM2FA1L443 756 aa42.26■■■■■ 4.36
SEMA3B-215ENST00000621029 NHSL1Q5SYE7 1610 aa42.26■■■■■ 4.36
SEMA3B-215ENST00000621029 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.25■■■■■ 4.35
SEMA3B-215ENST00000621029 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.24■■■■■ 4.35
SEMA3B-215ENST00000621029 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.24■■■■■ 4.35
SEMA3B-215ENST00000621029 SIRT1Q96EB6 747 aa42.23■■■■■ 4.35
SEMA3B-215ENST00000621029 SHPRHQ149N8 1683 aa42.22■■■■■ 4.35
SEMA3B-215ENST00000621029 STAC3Q96MF2 364 aa42.21■■■■■ 4.35
SEMA3B-215ENST00000621029 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP42.2■■■■■ 4.35
SEMA3B-215ENST00000621029 LRP6O75581 1613 aa42.2■■■■■ 4.35
SEMA3B-215ENST00000621029 PRAM1Q96QH2 718 aa42.19■■■■■ 4.34
SEMA3B-215ENST00000621029 POGKQ9P215 609 aa42.19■■■■■ 4.34
SEMA3B-215ENST00000621029 POTEAQ6S8J7 498 aa42.17■■■■■ 4.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAK1Q9UPV9 953 aa42.13■■■■■ 4.33
SEMA3B-215ENST00000621029 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
SEMA3B-215ENST00000621029 PNPLA6Q8IY17 1366 aa42.11■■■■■ 4.33
SEMA3B-215ENST00000621029 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.1■■■■■ 4.33
SEMA3B-215ENST00000621029 FOXO3O43524 673 aa42.08■■■■■ 4.33
SEMA3B-215ENST00000621029 ADGRB1O14514 1584 aa42.06■■■■■ 4.32
SEMA3B-215ENST00000621029 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
SEMA3B-215ENST00000621029 DLC1Q96QB1 1528 aa42.04■■■■■ 4.32
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
SEMA3B-215ENST00000621029 FMN2Q9NZ56 1722 aa42■■■■■ 4.31
SEMA3B-215ENST00000621029 ADAMTS2O95450 1211 aa41.97■■■■■ 4.31
SEMA3B-215ENST00000621029 C8orf37Q96NL8 207 aa41.97■■■■■ 4.31
SEMA3B-215ENST00000621029 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
SEMA3B-215ENST00000621029 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
SEMA3B-215ENST00000621029 AFF2P51816 1311 aa41.93■■■■■ 4.3
SEMA3B-215ENST00000621029 PHF8Q9UPP1 1060 aa41.92■■■■■ 4.3
SEMA3B-215ENST00000621029 PXDNQ92626 1479 aa41.92■■■■■ 4.3
SEMA3B-215ENST00000621029 NEUROD1Q13562 356 aa41.88■■■■■ 4.29
SEMA3B-215ENST00000621029 NGLY1Q96IV0 654 aa41.88■■■■■ 4.29
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.87■■■■■ 4.29
SEMA3B-215ENST00000621029 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.87■■■■■ 4.29
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF1AQ12756 1690 aa41.86■■■■■ 4.29
SEMA3B-215ENST00000621029 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.82■■■■■ 4.29
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.81■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 RXRBP28702 533 aa41.81■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 PSME1Q06323 249 aa41.81■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.81■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ADGRB2O60241 1585 aa41.8■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.79■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.77■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
SEMA3B-215ENST00000621029 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.74■■■■■ 4.27
SEMA3B-215ENST00000621029 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
SEMA3B-215ENST00000621029 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.73■■■■■ 4.27
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
SEMA3B-215ENST00000621029 PLEKHG5O94827 1062 aa41.72■■■■■ 4.27
SEMA3B-215ENST00000621029 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.7■■■■■ 4.27
SEMA3B-215ENST00000621029 USP32Q8NFA0 1604 aa41.69■■■■■ 4.27
SEMA3B-215ENST00000621029 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
SEMA3B-215ENST00000621029 USP21Q9UK80 565 aa41.69■■■■■ 4.26
SEMA3B-215ENST00000621029 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.69■■■■■ 4.26
SEMA3B-215ENST00000621029 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.66■■■■■ 4.26
SEMA3B-215ENST00000621029 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
SEMA3B-215ENST00000621029 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.64■■■■■ 4.26
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK19Q9BWU1 502 aa41.64■■■■■ 4.26
SEMA3B-215ENST00000621029 SBNO1A3KN83 1393 aa41.63■■■■■ 4.26
SEMA3B-215ENST00000621029 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
SEMA3B-215ENST00000621029 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
SEMA3B-215ENST00000621029 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
SEMA3B-215ENST00000621029 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.59■■■■■ 4.25
SEMA3B-215ENST00000621029 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGEF10O15013 1369 aa41.59■■■■■ 4.25
SEMA3B-215ENST00000621029 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
SEMA3B-215ENST00000621029 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP7BP35670 1465 aa41.52■■■■■ 4.24
SEMA3B-215ENST00000621029 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
SEMA3B-215ENST00000621029 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.48■■■■■ 4.23
SEMA3B-215ENST00000621029 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
SEMA3B-215ENST00000621029 TONSLQ96HA7 1378 aa41.45■■■■■ 4.23
SEMA3B-215ENST00000621029 RGS12O14924 1447 aa41.44■■■■■ 4.23
SEMA3B-215ENST00000621029 ITSN1Q15811 1721 aa41.44■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.44■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 ATRNO75882 1429 aa41.44■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.43■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 CABP2Q9NPB3 220 aa41.42■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.4■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.4■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 ACEP12821 1306 aa41.4■■■■■ 4.22
SEMA3B-215ENST00000621029 QRICH2Q9H0J4 1663 aa41.36■■■■■ 4.21
SEMA3B-215ENST00000621029 PLEKHG3A1L390 1219 aa41.36■■■■■ 4.21
SEMA3B-215ENST00000621029 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
SEMA3B-215ENST00000621029 SLIT2O94813 1529 aa41.34■■■■■ 4.21
SEMA3B-215ENST00000621029 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
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