RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.37
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
SEMA3B-215	ENST00000621029	LAMC1	P11047	1609 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUTM2F	A1L443	756 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SEMA3B-215	ENST00000621029	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SEMA3B-215	ENST00000621029	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		42.25	■■■■■ 4.35
SEMA3B-215	ENST00000621029	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SEMA3B-215	ENST00000621029	SIRT1	Q96EB6	747 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SEMA3B-215	ENST00000621029	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.22	■■■■■ 4.35
SEMA3B-215	ENST00000621029	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.21	■■■■■ 4.35
SEMA3B-215	ENST00000621029	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	42.2	■■■■■ 4.35
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRP6	O75581	1613 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRAM1	Q96QH2	718 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SEMA3B-215	ENST00000621029	POGK	Q9P215	609 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SEMA3B-215	ENST00000621029	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		42.13	■■■■■ 4.33
SEMA3B-215	ENST00000621029	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	42.11	■■■■■ 4.33
SEMA3B-215	ENST00000621029	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		42.11	■■■■■ 4.33
SEMA3B-215	ENST00000621029	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		42.1	■■■■■ 4.33
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOXO3	O43524	673 aa		42.08	■■■■■ 4.33
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADGRB1	O14514	1584 aa		42.06	■■■■■ 4.32
SEMA3B-215	ENST00000621029	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
SEMA3B-215	ENST00000621029	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.03	■■■■■ 4.32
SEMA3B-215	ENST00000621029	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		42	■■■■■ 4.31
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAMTS2	O95450	1211 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SEMA3B-215	ENST00000621029	C8orf37	Q96NL8	207 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SEMA3B-215	ENST00000621029	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
SEMA3B-215	ENST00000621029	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	41.96	■■■■■ 4.31
SEMA3B-215	ENST00000621029	AFF2	P51816	1311 aa		41.93	■■■■■ 4.3
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		41.92	■■■■■ 4.3
SEMA3B-215	ENST00000621029	PXDN	Q92626	1479 aa		41.92	■■■■■ 4.3
SEMA3B-215	ENST00000621029	NEUROD1	Q13562	356 aa		41.88	■■■■■ 4.29
SEMA3B-215	ENST00000621029	NGLY1	Q96IV0	654 aa		41.88	■■■■■ 4.29
SEMA3B-215	ENST00000621029	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SEMA3B-215	ENST00000621029	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF1A	Q12756	1690 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SEMA3B-215	ENST00000621029	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		41.82	■■■■■ 4.29
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	RXRB	P28702	533 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSME1	Q06323	249 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADGRB2	O60241	1585 aa		41.8	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	41.8	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		41.79	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	41.78	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		41.77	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	41.77	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
SEMA3B-215	ENST00000621029	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		41.74	■■■■■ 4.27
SEMA3B-215	ENST00000621029	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	41.74	■■■■■ 4.27
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	41.72	■■■■■ 4.27
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLEKHG5	O94827	1062 aa		41.72	■■■■■ 4.27
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		41.7	■■■■■ 4.27
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP32	Q8NFA0	1604 aa		41.69	■■■■■ 4.27
SEMA3B-215	ENST00000621029	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	41.69	■■■■■ 4.26
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP21	Q9UK80	565 aa		41.69	■■■■■ 4.26
SEMA3B-215	ENST00000621029	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		41.69	■■■■■ 4.26
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		41.66	■■■■■ 4.26
SEMA3B-215	ENST00000621029	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDK19	Q9BWU1	502 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SEMA3B-215	ENST00000621029	SBNO1	A3KN83	1393 aa		41.63	■■■■■ 4.26
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.25
SEMA3B-215	ENST00000621029	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	41.62	■■■■■ 4.25
SEMA3B-215	ENST00000621029	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	41.61	■■■■■ 4.25
SEMA3B-215	ENST00000621029	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		41.59	■■■■■ 4.25
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	41.59	■■■■■ 4.25
SEMA3B-215	ENST00000621029	ARHGEF10	O15013	1369 aa		41.59	■■■■■ 4.25
SEMA3B-215	ENST00000621029	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	41.58	■■■■■ 4.25
SEMA3B-215	ENST00000621029	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	41.54	■■■■■ 4.24
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	41.53	■■■■■ 4.24
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP7B	P35670	1465 aa		41.52	■■■■■ 4.24
SEMA3B-215	ENST00000621029	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	41.5	■■■■■ 4.23
SEMA3B-215	ENST00000621029	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	41.5	■■■■■ 4.23
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		41.48	■■■■■ 4.23
SEMA3B-215	ENST00000621029	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	41.46	■■■■■ 4.23
SEMA3B-215	ENST00000621029	TONSL	Q96HA7	1378 aa		41.45	■■■■■ 4.23
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGS12	O14924	1447 aa		41.44	■■■■■ 4.23
SEMA3B-215	ENST00000621029	ITSN1	Q15811	1721 aa		41.44	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		41.44	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATRN	O75882	1429 aa		41.44	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		41.43	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	CABP2	Q9NPB3	220 aa		41.42	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		41.4	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		41.4	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	41.4	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACE	P12821	1306 aa		41.4	■■■■■ 4.22
SEMA3B-215	ENST00000621029	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		41.36	■■■■■ 4.21
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		41.36	■■■■■ 4.21
SEMA3B-215	ENST00000621029	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	41.35	■■■■■ 4.21
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLIT2	O94813	1529 aa		41.34	■■■■■ 4.21
SEMA3B-215	ENST00000621029	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	41.34	■■■■■ 4.21

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