RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
PPP1CC-211ENST00000620030 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.62■■■■□ 3.13
PPP1CC-211ENST00000620030 SHPRHQ149N8 1683 aa34.6■■■■□ 3.13
PPP1CC-211ENST00000620030 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.6■■■■□ 3.13
PPP1CC-211ENST00000620030 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.53■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.52■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.52■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.52■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 LAMC1P11047 1609 aa34.52■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.51■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 STAC3Q96MF2 364 aa34.51■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.51■■■■□ 3.12
PPP1CC-211ENST00000620030 NUTM2FA1L443 756 aa34.47■■■■□ 3.11
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
PPP1CC-211ENST00000620030 PRAM1Q96QH2 718 aa34.44■■■■□ 3.1
PPP1CC-211ENST00000620030 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.42■■■■□ 3.1
PPP1CC-211ENST00000620030 FOXO3O43524 673 aa34.42■■■■□ 3.1
PPP1CC-211ENST00000620030 ADGRB1O14514 1584 aa34.4■■■■□ 3.1
PPP1CC-211ENST00000620030 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
PPP1CC-211ENST00000620030 DLC1Q96QB1 1528 aa34.37■■■■□ 3.09
PPP1CC-211ENST00000620030 POGKQ9P215 609 aa34.37■■■■□ 3.09
PPP1CC-211ENST00000620030 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.36■■■■□ 3.09
PPP1CC-211ENST00000620030 AFF2P51816 1311 aa34.35■■■■□ 3.09
PPP1CC-211ENST00000620030 PXDNQ92626 1479 aa34.34■■■■□ 3.09
PPP1CC-211ENST00000620030 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
PPP1CC-211ENST00000620030 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.33■■■■□ 3.09
PPP1CC-211ENST00000620030 C8orf37Q96NL8 207 aa34.32■■■■□ 3.08
PPP1CC-211ENST00000620030 ADAMTS2O95450 1211 aa34.31■■■■□ 3.08
PPP1CC-211ENST00000620030 RXRBP28702 533 aa34.27■■■■□ 3.08
PPP1CC-211ENST00000620030 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.27■■■■□ 3.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NGLY1Q96IV0 654 aa34.26■■■■□ 3.08
PPP1CC-211ENST00000620030 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.25■■■■□ 3.07
PPP1CC-211ENST00000620030 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
PPP1CC-211ENST00000620030 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
PPP1CC-211ENST00000620030 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.23■■■■□ 3.07
PPP1CC-211ENST00000620030 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
PPP1CC-211ENST00000620030 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
PPP1CC-211ENST00000620030 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.19■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF1AQ12756 1690 aa34.19■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 ADGRB2O60241 1585 aa34.18■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 PSME1Q06323 249 aa34.16■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.14■■■■□ 3.06
PPP1CC-211ENST00000620030 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.13■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.13■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 USP21Q9UK80 565 aa34.13■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 USP32Q8NFA0 1604 aa34.12■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.1■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 SBNO1A3KN83 1393 aa34.1■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.09■■■■□ 3.05
PPP1CC-211ENST00000620030 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.06■■■■□ 3.04
PPP1CC-211ENST00000620030 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PPP1CC-211ENST00000620030 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.05■■■■□ 3.04
PPP1CC-211ENST00000620030 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.05■■■■□ 3.04
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PPP1CC-211ENST00000620030 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.02■■■■□ 3.04
PPP1CC-211ENST00000620030 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.01■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.01■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 CDK19Q9BWU1 502 aa34.01■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 ATRNO75882 1429 aa34.01■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 RGS12O14924 1447 aa34■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGEF10O15013 1369 aa33.99■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 NEUROD1Q13562 356 aa33.99■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.99■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.98■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
PPP1CC-211ENST00000620030 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP7BP35670 1465 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 SLIT2O94813 1529 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 PLEKHG5O94827 1062 aa33.92■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC61Q9Y6R9 512 aa33.9■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
PPP1CC-211ENST00000620030 PLEKHG3A1L390 1219 aa33.86■■■■□ 3.01
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM83GA6ND36 823 aa33.86■■■■□ 3.01
PPP1CC-211ENST00000620030 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
PPP1CC-211ENST00000620030 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.83■■■■□ 3.01
PPP1CC-211ENST00000620030 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
PPP1CC-211ENST00000620030 ACEP12821 1306 aa33.82■■■■□ 3.01
PPP1CC-211ENST00000620030 ALS2Q96Q42 1657 aa33.82■■■■□ 3
PPP1CC-211ENST00000620030 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
PPP1CC-211ENST00000620030 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
PPP1CC-211ENST00000620030 VPS72Q15906 364 aa33.78■■■■□ 3
PPP1CC-211ENST00000620030 CABP2Q9NPB3 220 aa33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms