RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS2O95450 1211 aa37.22■■■■□ 3.55
PTPRF-216ENST00000617451 NGLY1Q96IV0 654 aa37.2■■■■□ 3.55
PTPRF-216ENST00000617451 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa37.2■■■■□ 3.55
PTPRF-216ENST00000617451 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 TECPR2O15040 1411 aa37.19■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 STK26Q9P289 416 aa37.18■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 ESCO1Q5FWF5 840 aa37.17■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 IFT172Q9UG01 1749 aa37.16■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 WAPLQ7Z5K2 1190 aa37.15■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 NPHP3Q7Z494 1330 aa37.14■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 ABCC11Q96J66 1382 aa37.14■■■■□ 3.54
PTPRF-216ENST00000617451 RGS12O14924 1447 aa37.12■■■■□ 3.53
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3C2GO75747 1445 aa37.12■■■■□ 3.53
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.12■■■■□ 3.53
PTPRF-216ENST00000617451 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
PTPRF-216ENST00000617451 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
PTPRF-216ENST00000617451 PXDNQ92626 1479 aa37.08■■■■□ 3.53
PTPRF-216ENST00000617451 FOXO3O43524 673 aa37.08■■■■□ 3.53
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa37.07■■■■□ 3.53
PTPRF-216ENST00000617451 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
PTPRF-216ENST00000617451 USP21Q9UK80 565 aa37.07■■■■□ 3.52
PTPRF-216ENST00000617451 KNDC1Q76NI1 1749 aa37.05■■■■□ 3.52
PTPRF-216ENST00000617451 MYOM2P54296 1465 aa37.05■■■■□ 3.52
PTPRF-216ENST00000617451 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
PTPRF-216ENST00000617451 NUTM2FA1L443 756 aa37.04■■■■□ 3.52
PTPRF-216ENST00000617451 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
PTPRF-216ENST00000617451 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
PTPRF-216ENST00000617451 SIRT1Q96EB6 747 aa37■■■■□ 3.51
PTPRF-216ENST00000617451 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
PTPRF-216ENST00000617451 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.96■■■■□ 3.51
PTPRF-216ENST00000617451 ATRNO75882 1429 aa36.95■■■■□ 3.51
PTPRF-216ENST00000617451 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.95■■■■□ 3.51
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.92■■■■□ 3.5
PTPRF-216ENST00000617451 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PTPRF-216ENST00000617451 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.9■■■■□ 3.5
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.88■■■■□ 3.49
PTPRF-216ENST00000617451 KIF1AQ12756 1690 aa36.87■■■■□ 3.49
PTPRF-216ENST00000617451 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.87■■■■□ 3.49
PTPRF-216ENST00000617451 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
PTPRF-216ENST00000617451 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.86■■■■□ 3.49
PTPRF-216ENST00000617451 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.85■■■■□ 3.49
PTPRF-216ENST00000617451 PRAM1Q96QH2 718 aa36.82■■■■□ 3.48
PTPRF-216ENST00000617451 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.82■■■■□ 3.48
PTPRF-216ENST00000617451 EP400Q96L91 3159 aa36.79■■■■□ 3.48
PTPRF-216ENST00000617451 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
PTPRF-216ENST00000617451 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
PTPRF-216ENST00000617451 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
PTPRF-216ENST00000617451 DLC1Q96QB1 1528 aa36.75■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 PSME1Q06323 249 aa36.75■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.75■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 SLIT2O94813 1529 aa36.75■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 POGKQ9P215 609 aa36.74■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.74■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 USP32Q8NFA0 1604 aa36.7■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRB1O14514 1584 aa36.7■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 SBNO1A3KN83 1393 aa36.7■■■■□ 3.47
PTPRF-216ENST00000617451 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.69■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.68■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.67■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.66■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.65■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRB2O60241 1585 aa36.65■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.64■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.64■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 GLI3P10071 1580 aa36.64■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF10O15013 1369 aa36.64■■■■□ 3.46
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC125Q86Z20 511 aa36.63■■■■□ 3.45
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.63■■■■□ 3.45
PTPRF-216ENST00000617451 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.62■■■■□ 3.45
PTPRF-216ENST00000617451 STAC3Q96MF2 364 aa36.6■■■■□ 3.45
PTPRF-216ENST00000617451 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHG5O94827 1062 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPRF-216ENST00000617451 HRCP23327 699 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPRF-216ENST00000617451 VPS72Q15906 364 aa36.57■■■■□ 3.44
PTPRF-216ENST00000617451 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
PTPRF-216ENST00000617451 ABCA3Q99758 1704 aa36.54■■■■□ 3.44
PTPRF-216ENST00000617451 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.54■■■■□ 3.44
PTPRF-216ENST00000617451 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.52■■■■□ 3.44
PTPRF-216ENST00000617451 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
PTPRF-216ENST00000617451 FAM83GA6ND36 823 aa36.51■■■■□ 3.44
PTPRF-216ENST00000617451 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.51■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.5■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.5■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.5■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.49■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.45■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
PTPRF-216ENST00000617451 ALS2Q96Q42 1657 aa36.44■■■■□ 3.42
PTPRF-216ENST00000617451 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
PTPRF-216ENST00000617451 BTG4Q9NY30 223 aa36.38■■■■□ 3.41
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
PTPRF-216ENST00000617451 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.37■■■■□ 3.41
PTPRF-216ENST00000617451 NRAPQ86VF7 1730 aa36.35■■■■□ 3.41
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