RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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HDGFL2-208ENST00000616600 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HDGFL2-208ENST00000616600 DIP2BQ9P265 1576 aa26.75■■□□□ 1.87
HDGFL2-208ENST00000616600 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.74■■□□□ 1.87
HDGFL2-208ENST00000616600 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.74■■□□□ 1.87
HDGFL2-208ENST00000616600 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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HDGFL2-208ENST00000616600 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.71■■□□□ 1.87
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HDGFL2-208ENST00000616600 MORC1Q86VD1 984 aa26.68■■□□□ 1.86
HDGFL2-208ENST00000616600 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.68■■□□□ 1.86
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HDGFL2-208ENST00000616600 USP32Q8NFA0 1604 aa26.66■■□□□ 1.86
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HDGFL2-208ENST00000616600 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.62■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.62■■□□□ 1.85
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HDGFL2-208ENST00000616600 AGLP35573 1532 aa26.62■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 TSPOAP1O95153 1857 aa26.62■■□□□ 1.85
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HDGFL2-208ENST00000616600 PDE4AP27815 886 aa26.61■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 CRBNQ96SW2 442 aa26.61■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 CABP2Q9NPB3 220 aa26.61■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 BACH2Q9BYV9 841 aa26.6■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 STK26Q9P289 416 aa26.6■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 MS4A1P11836 297 aa26.59■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
HDGFL2-208ENST00000616600 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
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HDGFL2-208ENST00000616600 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
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HDGFL2-208ENST00000616600 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.57■■□□□ 1.84
HDGFL2-208ENST00000616600 SHPRHQ149N8 1683 aa26.57■■□□□ 1.84
HDGFL2-208ENST00000616600 NSD2O96028 1365 aa26.56■■□□□ 1.84
HDGFL2-208ENST00000616600 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HDGFL2-208ENST00000616600 E9PSI1 815 aa26.54■■□□□ 1.84
HDGFL2-208ENST00000616600 MTHFSP49914 203 aa26.54■■□□□ 1.84
HDGFL2-208ENST00000616600 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.53■■□□□ 1.84
HDGFL2-208ENST00000616600 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
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HDGFL2-208ENST00000616600 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.52■■□□□ 1.84
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HDGFL2-208ENST00000616600 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.51■■□□□ 1.84
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HDGFL2-208ENST00000616600 RUNDC1Q96C34 613 aa26.49■■□□□ 1.83
HDGFL2-208ENST00000616600 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.49■■□□□ 1.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ABCC11Q96J66 1382 aa26.48■■□□□ 1.83
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HDGFL2-208ENST00000616600 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.48■■□□□ 1.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CFAP53Q96M91 514 aa26.48■■□□□ 1.83
HDGFL2-208ENST00000616600 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.47■■□□□ 1.83
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HDGFL2-208ENST00000616600 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.43■■□□□ 1.82
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HDGFL2-208ENST00000616600 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.41■■□□□ 1.82
HDGFL2-208ENST00000616600 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.41■■□□□ 1.82
HDGFL2-208ENST00000616600 BCAR3O75815 825 aa26.4■■□□□ 1.82
HDGFL2-208ENST00000616600 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.4■■□□□ 1.82
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HDGFL2-208ENST00000616600 CDK19Q9BWU1 502 aa26.4■■□□□ 1.82
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HDGFL2-208ENST00000616600 CCDC27Q2M243 656 aa26.37■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 DLC1Q96QB1 1528 aa26.37■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 MED14O60244 1454 aa26.36■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 NLRP1Q9C000 1473 aa26.36■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 WDR63Q8IWG1 891 aa26.36■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.35■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
HDGFL2-208ENST00000616600 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
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