RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCL3L3-201ENST00000612839 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.35■□□□□ 0.21
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.35■□□□□ 0.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.19■□□□□ 0.18
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