RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602733.5

TCP11L1-211, Transcript of t-complex 11 like 1, humanhuman

TSL 4

Gene TCP11L1, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1-211ENST00000602733 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.31■■■■□ 3.4
TCP11L1-211ENST00000602733 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.31■■■■□ 3.4
TCP11L1-211ENST00000602733 RGS12O14924 1447 aa36.3■■■■□ 3.4
TCP11L1-211ENST00000602733 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
TCP11L1-211ENST00000602733 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.28■■■■□ 3.4
TCP11L1-211ENST00000602733 STK26Q9P289 416 aa36.27■■■■□ 3.4
TCP11L1-211ENST00000602733 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.25■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 NGLY1Q96IV0 654 aa36.25■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.25■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.25■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 TECPR2O15040 1411 aa36.24■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.23■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 PXDNQ92626 1479 aa36.23■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 PIK3C2GO75747 1445 aa36.2■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.2■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 NUTM2FA1L443 756 aa36.2■■■■□ 3.39
TCP11L1-211ENST00000602733 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 ABCC11Q96J66 1382 aa36.17■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 MYOM2P54296 1465 aa36.17■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.17■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 FOXO3O43524 673 aa36.16■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 USP21Q9UK80 565 aa36.15■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.14■■■■□ 3.38
TCP11L1-211ENST00000602733 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
TCP11L1-211ENST00000602733 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
TCP11L1-211ENST00000602733 ATRNO75882 1429 aa36.08■■■■□ 3.37
TCP11L1-211ENST00000602733 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
TCP11L1-211ENST00000602733 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.05■■■■□ 3.36
TCP11L1-211ENST00000602733 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.05■■■■□ 3.36
TCP11L1-211ENST00000602733 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
TCP11L1-211ENST00000602733 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.04■■■■□ 3.36
TCP11L1-211ENST00000602733 KIF1AQ12756 1690 aa36.01■■■■□ 3.36
TCP11L1-211ENST00000602733 SIRT1Q96EB6 747 aa35.99■■■■□ 3.35
TCP11L1-211ENST00000602733 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.97■■■■□ 3.35
TCP11L1-211ENST00000602733 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.93■■■■□ 3.34
TCP11L1-211ENST00000602733 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.93■■■■□ 3.34
TCP11L1-211ENST00000602733 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
TCP11L1-211ENST00000602733 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
TCP11L1-211ENST00000602733 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.91■■■■□ 3.34
TCP11L1-211ENST00000602733 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.91■■■■□ 3.34
TCP11L1-211ENST00000602733 USP32Q8NFA0 1604 aa35.9■■■■□ 3.34
TCP11L1-211ENST00000602733 PRAM1Q96QH2 718 aa35.89■■■■□ 3.34
TCP11L1-211ENST00000602733 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.88■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 GLI3P10071 1580 aa35.88■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 EP400Q96L91 3159 aa35.88■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 SLIT2O94813 1529 aa35.88■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 ADGRB1O14514 1584 aa35.86■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 DLC1Q96QB1 1528 aa35.84■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 ABCA3Q99758 1704 aa35.84■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.84■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.83■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.83■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TCP11L1-211ENST00000602733 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.81■■■■□ 3.32
TCP11L1-211ENST00000602733 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.8■■■■□ 3.32
TCP11L1-211ENST00000602733 PLEKHG5O94827 1062 aa35.8■■■■□ 3.32
TCP11L1-211ENST00000602733 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.78■■■■□ 3.32
TCP11L1-211ENST00000602733 ADGRB2O60241 1585 aa35.78■■■■□ 3.32
TCP11L1-211ENST00000602733 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.77■■■■□ 3.32
TCP11L1-211ENST00000602733 SBNO1A3KN83 1393 aa35.76■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 POGKQ9P215 609 aa35.75■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.75■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 PSME1Q06323 249 aa35.74■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.74■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.71■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.71■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.71■■■■□ 3.31
TCP11L1-211ENST00000602733 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.69■■■■□ 3.3
TCP11L1-211ENST00000602733 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.69■■■■□ 3.3
TCP11L1-211ENST00000602733 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
TCP11L1-211ENST00000602733 ALS2Q96Q42 1657 aa35.67■■■■□ 3.3
TCP11L1-211ENST00000602733 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
TCP11L1-211ENST00000602733 FAM83GA6ND36 823 aa35.65■■■■□ 3.3
TCP11L1-211ENST00000602733 ARHGEF10O15013 1369 aa35.64■■■■□ 3.3
TCP11L1-211ENST00000602733 NRAPQ86VF7 1730 aa35.63■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 VPS72Q15906 364 aa35.63■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 CCDC125Q86Z20 511 aa35.62■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.62■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa35.61■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.6■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.6■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
TCP11L1-211ENST00000602733 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
TCP11L1-211ENST00000602733 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.54■■■■□ 3.28
TCP11L1-211ENST00000602733 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
TCP11L1-211ENST00000602733 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
TCP11L1-211ENST00000602733 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.52■■■■□ 3.28
TCP11L1-211ENST00000602733 HRCP23327 699 aa35.51■■■■□ 3.28
TCP11L1-211ENST00000602733 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
TCP11L1-211ENST00000602733 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.5■■■■□ 3.27
TCP11L1-211ENST00000602733 BTG4Q9NY30 223 aa35.48■■■■□ 3.27
TCP11L1-211ENST00000602733 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms