RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 ORAI2Q96SN7 254 aa30.86■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.86■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.83■■■□□ 2.53
TIMM50-216ENST00000601358 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 LAMC1P11047 1609 aa30.81■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.81■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.81■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.81■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 SHPRHQ149N8 1683 aa30.8■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 NUTM2FA1L443 756 aa30.8■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 SIRT1Q96EB6 747 aa30.79■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 STAC3Q96MF2 364 aa30.79■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.77■■■□□ 2.52
TIMM50-216ENST00000601358 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.76■■■□□ 2.51
TIMM50-216ENST00000601358 POTEAQ6S8J7 498 aa30.76■■■□□ 2.51
TIMM50-216ENST00000601358 PRAM1Q96QH2 718 aa30.75■■■□□ 2.51
TIMM50-216ENST00000601358 POGKQ9P215 609 aa30.75■■■□□ 2.51
TIMM50-216ENST00000601358 LRP6O75581 1613 aa30.74■■■□□ 2.51
TIMM50-216ENST00000601358 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.71■■■□□ 2.51
TIMM50-216ENST00000601358 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
TIMM50-216ENST00000601358 FOXO3O43524 673 aa30.69■■■□□ 2.5
TIMM50-216ENST00000601358 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.68■■■□□ 2.5
TIMM50-216ENST00000601358 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.68■■■□□ 2.5
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
TIMM50-216ENST00000601358 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
TIMM50-216ENST00000601358 ADGRB1O14514 1584 aa30.64■■■□□ 2.49
TIMM50-216ENST00000601358 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.63■■■□□ 2.49
TIMM50-216ENST00000601358 DLC1Q96QB1 1528 aa30.63■■■□□ 2.49
TIMM50-216ENST00000601358 ADAMTS2O95450 1211 aa30.6■■■□□ 2.49
TIMM50-216ENST00000601358 C8orf37Q96NL8 207 aa30.6■■■□□ 2.49
TIMM50-216ENST00000601358 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
TIMM50-216ENST00000601358 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
TIMM50-216ENST00000601358 AFF2P51816 1311 aa30.57■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.56■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 NGLY1Q96IV0 654 aa30.55■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 PXDNQ92626 1479 aa30.55■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.53■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 KIF1AQ12756 1690 aa30.52■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 NEUROD1Q13562 356 aa30.51■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.51■■■□□ 2.48
TIMM50-216ENST00000601358 RXRBP28702 533 aa30.5■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 PSME1Q06323 249 aa30.5■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.49■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.47■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.46■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 ADGRB2O60241 1585 aa30.46■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.46■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.45■■■□□ 2.47
TIMM50-216ENST00000601358 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.44■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.44■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 PLEKHG5O94827 1062 aa30.4■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 USP21Q9UK80 565 aa30.4■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 USP32Q8NFA0 1604 aa30.4■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
TIMM50-216ENST00000601358 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.39■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.37■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 CDK19Q9BWU1 502 aa30.36■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.36■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 SBNO1A3KN83 1393 aa30.35■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.35■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TIMM50-216ENST00000601358 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.32■■■□□ 2.44
TIMM50-216ENST00000601358 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF10O15013 1369 aa30.31■■■□□ 2.44
TIMM50-216ENST00000601358 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
TIMM50-216ENST00000601358 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
TIMM50-216ENST00000601358 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
TIMM50-216ENST00000601358 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
TIMM50-216ENST00000601358 ITSN1Q15811 1721 aa30.25■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.25■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 ATP7BP35670 1465 aa30.24■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.21■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 RGS12O14924 1447 aa30.2■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 ATRNO75882 1429 aa30.2■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.2■■■□□ 2.43
TIMM50-216ENST00000601358 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.19■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 CABP2Q9NPB3 220 aa30.19■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 TONSLQ96HA7 1378 aa30.18■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 ACEP12821 1306 aa30.17■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.17■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.16■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.15■■■□□ 2.42
TIMM50-216ENST00000601358 ALS2Q96Q42 1657 aa30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms