RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
MBD3-211ENST00000592965 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.33■■■■□ 3.09
MBD3-211ENST00000592965 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
MBD3-211ENST00000592965 ORAI2Q96SN7 254 aa34.3■■■■□ 3.08
MBD3-211ENST00000592965 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.3■■■■□ 3.08
MBD3-211ENST00000592965 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.28■■■■□ 3.08
MBD3-211ENST00000592965 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
MBD3-211ENST00000592965 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.27■■■■□ 3.08
MBD3-211ENST00000592965 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
MBD3-211ENST00000592965 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
MBD3-211ENST00000592965 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
MBD3-211ENST00000592965 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
MBD3-211ENST00000592965 SIRT1Q96EB6 747 aa34.24■■■■□ 3.07
MBD3-211ENST00000592965 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.24■■■■□ 3.07
MBD3-211ENST00000592965 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.22■■■■□ 3.07
MBD3-211ENST00000592965 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
MBD3-211ENST00000592965 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.18■■■■□ 3.06
MBD3-211ENST00000592965 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.17■■■■□ 3.06
MBD3-211ENST00000592965 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
MBD3-211ENST00000592965 DLC1Q96QB1 1528 aa34.17■■■■□ 3.06
MBD3-211ENST00000592965 ADGRB1O14514 1584 aa34.16■■■■□ 3.06
MBD3-211ENST00000592965 PXDNQ92626 1479 aa34.16■■■■□ 3.06
MBD3-211ENST00000592965 KIF1AQ12756 1690 aa34.14■■■■□ 3.06
MBD3-211ENST00000592965 AFF2P51816 1311 aa34.12■■■■□ 3.05
MBD3-211ENST00000592965 STAC3Q96MF2 364 aa34.12■■■■□ 3.05
MBD3-211ENST00000592965 NUTM2FA1L443 756 aa34.09■■■■□ 3.05
MBD3-211ENST00000592965 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.08■■■■□ 3.05
MBD3-211ENST00000592965 FOXO3O43524 673 aa34.07■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 C8orf37Q96NL8 207 aa34.07■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 PRAM1Q96QH2 718 aa34.07■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 ADGRB2O60241 1585 aa34.06■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.04■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 ADAMTS2O95450 1211 aa34.02■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 RXRBP28702 533 aa34.02■■■■□ 3.04
MBD3-211ENST00000592965 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 POGKQ9P215 609 aa34■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.99■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 ANKARQ7Z5J8 1434 aa33.97■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 NGLY1Q96IV0 654 aa33.97■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 USP32Q8NFA0 1604 aa33.97■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.96■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 PHF8Q9UPP1 1060 aa33.95■■■■□ 3.03
MBD3-211ENST00000592965 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
MBD3-211ENST00000592965 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.93■■■■□ 3.02
MBD3-211ENST00000592965 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
MBD3-211ENST00000592965 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.92■■■■□ 3.02
MBD3-211ENST00000592965 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
MBD3-211ENST00000592965 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
MBD3-211ENST00000592965 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.89■■■■□ 3.02
MBD3-211ENST00000592965 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.88■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 RGS12O14924 1447 aa33.87■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 USP21Q9UK80 565 aa33.87■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.87■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 SBNO1A3KN83 1393 aa33.85■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 PSME1Q06323 249 aa33.84■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 ATRNO75882 1429 aa33.83■■■■□ 3.01
MBD3-211ENST00000592965 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 WASLO00401 505 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.8■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 ABCA3Q99758 1704 aa33.79■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.79■■■■□ 38e-9■■□□□ 13.9
MBD3-211ENST00000592965 PRR36Q9H6K5 1346 aa33.79■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 ARHGEF10O15013 1369 aa33.77■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 ITSN1Q15811 1721 aa33.77■■■■□ 3
MBD3-211ENST00000592965 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.76■■■□□ 2.99
MBD3-211ENST00000592965 SLIT2O94813 1529 aa33.74■■■□□ 2.99
MBD3-211ENST00000592965 ALS2Q96Q42 1657 aa33.72■■■□□ 2.99
MBD3-211ENST00000592965 ATP7BP35670 1465 aa33.72■■■□□ 2.99
MBD3-211ENST00000592965 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.71■■■□□ 2.99
MBD3-211ENST00000592965 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.67■■■□□ 2.98
MBD3-211ENST00000592965 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.67■■■□□ 2.98
MBD3-211ENST00000592965 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.67■■■□□ 2.98
MBD3-211ENST00000592965 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
MBD3-211ENST00000592965 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.66■■■□□ 2.98
MBD3-211ENST00000592965 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa33.66■■■□□ 2.98
MBD3-211ENST00000592965 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.66■■■□□ 2.98
MBD3-211ENST00000592965 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.65■■■□□ 2.98
MBD3-211ENST00000592965 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.61■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.6■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 GLI3P10071 1580 aa33.6■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.6■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 CDK19Q9BWU1 502 aa33.6■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.6■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 EP400Q96L91 3159 aa33.59■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa33.57■■■□□ 2.97
MBD3-211ENST00000592965 PLEKHG5O94827 1062 aa33.57■■■□□ 2.96
MBD3-211ENST00000592965 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.57■■■□□ 2.96
MBD3-211ENST00000592965 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.56■■■□□ 2.96
MBD3-211ENST00000592965 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
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