RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.34	■■■□□ 2.77
APBA3-208	ENST00000592826	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
APBA3-208	ENST00000592826	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.31	■■■□□ 2.76
APBA3-208	ENST00000592826	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.31	■■■□□ 2.76
APBA3-208	ENST00000592826	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.31	■■■□□ 2.76
APBA3-208	ENST00000592826	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.3	■■■□□ 2.76
APBA3-208	ENST00000592826	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.29	■■■□□ 2.76
APBA3-208	ENST00000592826	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.28	■■■□□ 2.76
APBA3-208	ENST00000592826	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.26	■■■□□ 2.75
APBA3-208	ENST00000592826	POGK	Q9P215	609 aa		32.25	■■■□□ 2.75
APBA3-208	ENST00000592826	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.25	■■■□□ 2.75
APBA3-208	ENST00000592826	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
APBA3-208	ENST00000592826	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.24	■■■□□ 2.75
APBA3-208	ENST00000592826	MST1R	Q04912	1400 aa		32.24	■■■□□ 2.75
APBA3-208	ENST00000592826	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.22	■■■□□ 2.75
APBA3-208	ENST00000592826	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.2	■■■□□ 2.75
APBA3-208	ENST00000592826	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.18	■■■□□ 2.74
APBA3-208	ENST00000592826	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.18	■■■□□ 2.74
APBA3-208	ENST00000592826	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.17	■■■□□ 2.74
APBA3-208	ENST00000592826	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.16	■■■□□ 2.74
APBA3-208	ENST00000592826	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
APBA3-208	ENST00000592826	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.15	■■■□□ 2.74
APBA3-208	ENST00000592826	LRP6	O75581	1613 aa		32.15	■■■□□ 2.74
APBA3-208	ENST00000592826	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.12	■■■□□ 2.73
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
APBA3-208	ENST00000592826	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.09	■■■□□ 2.73
APBA3-208	ENST00000592826	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
APBA3-208	ENST00000592826	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
APBA3-208	ENST00000592826	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.07	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.06	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.04	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.04	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.03	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.03	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.01	■■■□□ 2.72
APBA3-208	ENST00000592826	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.98	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.97	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.97	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.95	■■■□□ 2.71
APBA3-208	ENST00000592826	RXRB	P28702	533 aa		31.94	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.91	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.91	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.9	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	FOXO3	O43524	673 aa		31.89	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.89	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
APBA3-208	ENST00000592826	AFF2	P51816	1311 aa		31.88	■■■□□ 2.69
APBA3-208	ENST00000592826	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	31.86	■■■□□ 2.69
APBA3-208	ENST00000592826	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.85	■■■□□ 2.69
APBA3-208	ENST00000592826	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
APBA3-208	ENST00000592826	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.83	■■■□□ 2.69
APBA3-208	ENST00000592826	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.83	■■■□□ 2.69
APBA3-208	ENST00000592826	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
APBA3-208	ENST00000592826	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.82	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	PSME1	Q06323	249 aa		31.82	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.81	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.81	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	PXDN	Q92626	1479 aa		31.8	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.8	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.8	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.8	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.78	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	ATP7B	P35670	1465 aa		31.78	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.77	■■■□□ 2.68
APBA3-208	ENST00000592826	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.76	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.73	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.72	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.72	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.72	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.71	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.7	■■■□□ 2.67
APBA3-208	ENST00000592826	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	RGS12	O14924	1447 aa		31.66	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.66	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.65	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.65	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.65	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.65	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.65	■■■□□ 2.66
APBA3-208	ENST00000592826	USP47	Q96K76	1375 aa		31.64	■■■□□ 2.66

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