RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-214ENST00000592483 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-214ENST00000592483 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-214ENST00000592483 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP155O75694 1391 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-214ENST00000592483 MYOM2P54296 1465 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-214ENST00000592483 LRP5O75197 1615 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-214ENST00000592483 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-214ENST00000592483 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-214ENST00000592483 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-214ENST00000592483 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-214ENST00000592483 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-214ENST00000592483 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-214ENST00000592483 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-214ENST00000592483 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-214ENST00000592483 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-214ENST00000592483 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-214ENST00000592483 PXDNQ92626 1479 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-214ENST00000592483 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-214ENST00000592483 GLI3P10071 1580 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-214ENST00000592483 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXO3O43524 673 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-214ENST00000592483 SLIT2O94813 1529 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-214ENST00000592483 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-214ENST00000592483 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-214ENST00000592483 BRWD3Q6RI45 1802 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-214ENST00000592483 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-214ENST00000592483 CLTCL1P53675 1640 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.49■■■■□ 3.11
CAPNS1-214ENST00000592483 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-214ENST00000592483 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF1BO60333 1816 aa34.46■■■■□ 3.11
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS72Q15906 364 aa34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-214ENST00000592483 BAG6P46379 1132 aa34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-214ENST00000592483 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-214ENST00000592483 USP32Q8NFA0 1604 aa34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-214ENST00000592483 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-214ENST00000592483 NUTM2FA1L443 756 aa34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-214ENST00000592483 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-214ENST00000592483 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-214ENST00000592483 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-214ENST00000592483 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-214ENST00000592483 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF1AQ12756 1690 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 TECPR2O15040 1411 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A0G2JS52 829 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 MYT1Q01538 1121 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 PPLO60437 1756 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 PSME1Q06323 249 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 STK26Q9P289 416 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-214ENST00000592483 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM83GA6ND36 823 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 YY1P25490 414 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC11Q96J66 1382 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 DISP2A7MBM2 1401 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHG5O94827 1062 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 SBNO1A3KN83 1393 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF10O15013 1369 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-214ENST00000592483 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCA3Q99758 1704 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM182BQ5T319 152 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-214ENST00000592483 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 BTG4Q9NY30 223 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 NRAPQ86VF7 1730 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 SIRT1Q96EB6 747 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.01■■■■□ 3.03
CAPNS1-214ENST00000592483 SIN3AQ96ST3 1273 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-214ENST00000592483 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-214ENST00000592483 IFT172Q9UG01 1749 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-214ENST00000592483 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-214ENST00000592483 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
CAPNS1-214ENST00000592483 NEUROD1Q13562 356 aa33.95■■■■□ 3.03
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