RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 HRCP23327 699 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-210ENST00000591412 PNPLA6Q8IY17 1366 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-210ENST00000591412 MYOM2P54296 1465 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-210ENST00000591412 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-210ENST00000591412 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.64■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.63■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 SIRT1Q96EB6 747 aa19.62■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.61■□□□□ 0.73
CTIF-210ENST00000591412 ESCO1Q5FWF5 840 aa19.58■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 AFF2P51816 1311 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 NPHP3Q7Z494 1330 aa19.55■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 PXDNQ92626 1479 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 NUTM2FA1L443 756 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 FOXO3O43524 673 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 C8orf37Q96NL8 207 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 ADGRB1O14514 1584 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 FMN2Q9NZ56 1722 aa19.52■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 RXRBP28702 533 aa19.52■□□□□ 0.72
CTIF-210ENST00000591412 DLC1Q96QB1 1528 aa19.51■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 ADAMTS2O95450 1211 aa19.51■□□□□ 0.71
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CTIF-210ENST00000591412 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
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CTIF-210ENST00000591412 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.5■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 STAC3Q96MF2 364 aa19.5■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.49■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 NGLY1Q96IV0 654 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 KIF1AQ12756 1690 aa19.46■□□□□ 0.71
CTIF-210ENST00000591412 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 POGKQ9P215 609 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 ADGRB2O60241 1585 aa19.43■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 ANKARQ7Z5J8 1434 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.41■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 USP21Q9UK80 565 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 RGS12O14924 1447 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-210ENST00000591412 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
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CTIF-210ENST00000591412 ATRNO75882 1429 aa19.38■□□□□ 0.69
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CTIF-210ENST00000591412 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.35■□□□□ 0.69
CTIF-210ENST00000591412 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
CTIF-210ENST00000591412 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.34■□□□□ 0.69
CTIF-210ENST00000591412 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
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CTIF-210ENST00000591412 ARHGEF10O15013 1369 aa19.32■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.31■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.3■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.29■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 UNC5CLQ8IV45 518 aa19.29■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.27■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.27■□□□□ 0.68
CTIF-210ENST00000591412 ATP7BP35670 1465 aa19.27■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 ABCA3Q99758 1704 aa19.25■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 CDK19Q9BWU1 502 aa19.25■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 ALS2Q96Q42 1657 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 PLEKHG5O94827 1062 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.24■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 ATAD2Q6PL18 1390 aa19.23■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 GLI3P10071 1580 aa19.23■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 FAM83GA6ND36 823 aa19.22■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.22■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.22■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 VPS72Q15906 364 aa19.21■□□□□ 0.67
CTIF-210ENST00000591412 ITSN1Q15811 1721 aa19.2■□□□□ 0.66
CTIF-210ENST00000591412 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CTIF-210ENST00000591412 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CTIF-210ENST00000591412 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-210ENST00000591412 PLCH1Q4KWH8 1693 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-210ENST00000591412 NWD2Q9ULI1 1742 aa19.19■□□□□ 0.66
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