RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC144AA2RUR9 1427 aa38.48■■■■□ 3.75
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa38.46■■■■□ 3.75
CAPNS1-211ENST00000590874 RGL3Q3MIN7 710 aa38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ESCO1Q5FWF5 840 aa38.42■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TECPR2O15040 1411 aa38.41■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 STK26Q9P289 416 aa38.4■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 USP21Q9UK80 565 aa38.4■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 NPHP3Q7Z494 1330 aa38.39■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.39■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PXDNQ92626 1479 aa38.39■■■■□ 3.74
CAPNS1-211ENST00000590874 WAPLQ7Z5K2 1190 aa38.38■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa38.38■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT172Q9UG01 1749 aa38.38■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOM2P54296 1465 aa38.37■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa38.34■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM132EQ6IEE7 984 aa38.34■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3C2GO75747 1445 aa38.34■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXO3O43524 673 aa38.33■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC11Q96J66 1382 aa38.32■■■■□ 3.73
CAPNS1-211ENST00000590874 NUTM2FA1L443 756 aa38.32■■■■□ 3.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ATRNO75882 1429 aa38.3■■■■□ 3.72
CAPNS1-211ENST00000590874 KNDC1Q76NI1 1749 aa38.29■■■■□ 3.72
CAPNS1-211ENST00000590874 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ATAD2Q6PL18 1390 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL9LQ86UU0 1499 aa38.23■■■■□ 3.71
CAPNS1-211ENST00000590874 FMN2Q9NZ56 1722 aa38.21■■■■□ 3.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
CAPNS1-211ENST00000590874 NRXN1Q9ULB1 1477 aa38.15■■■■□ 3.7
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF1AQ12756 1690 aa38.14■■■■□ 3.7
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa38.13■■■■□ 3.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SIRT1Q96EB6 747 aa38.13■■■■□ 3.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP70Q5T0N1 1121 aa38.1■■■■□ 3.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT28Q7Z3Y7 464 aa38.08■■■■□ 3.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SLIT2O94813 1529 aa38.06■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF8Q9UPP1 1060 aa38.04■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 USP32Q8NFA0 1604 aa38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC5CLQ8IV45 518 aa38.02■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TNS3Q68CZ2 1445 aa38.02■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP38.01■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAM1Q96QH2 718 aa38.01■■■■□ 3.68
CAPNS1-211ENST00000590874 RALGAPBQ86X10 1494 aa38■■■■□ 3.67
CAPNS1-211ENST00000590874 GLI3P10071 1580 aa38■■■■□ 3.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PSME1Q06323 249 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-211ENST00000590874 CABLES1Q8TDN4 633 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-211ENST00000590874 DLC1Q96QB1 1528 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-211ENST00000590874 EP400Q96L91 3159 aa37.94■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.94■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SBNO1A3KN83 1393 aa37.93■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHG5O94827 1062 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRB1O14514 1584 aa37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC125Q86Z20 511 aa37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 POGKQ9P215 609 aa37.9■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKARQ7Z5J8 1434 aa37.89■■■■□ 3.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRB2O60241 1585 aa37.88■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 LMOD2Q6P5Q4 547 aa37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA3Q99758 1704 aa37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF10O15013 1369 aa37.86■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ZRANB1Q9UGI0 708 aa37.85■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCH1Q4KWH8 1693 aa37.84■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS72Q15906 364 aa37.83■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAK1Q9UPV9 953 aa37.83■■■■□ 3.65
CAPNS1-211ENST00000590874 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT12Q8IYM1 358 aa37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 NWD2Q9ULI1 1742 aa37.79■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 BRWD3Q6RI45 1802 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR36Q9H6K5 1346 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM83GA6ND36 823 aa37.76■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.76■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.74■■■■□ 3.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TULP4Q9NRJ4 1543 aa37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GPRASP1Q5JY77 1395 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB132Q7Z7B7 95 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ALS2Q96Q42 1657 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-211ENST00000590874 WASLO00401 505 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NRAPQ86VF7 1730 aa37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT27Q7Z3Y8 459 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-211ENST00000590874 BTG4Q9NY30 223 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
CAPNS1-211ENST00000590874 STAC3Q96MF2 364 aa37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-211ENST00000590874 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
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