RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC11Q96J66 1382 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-211ENST00000588374 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 NUTM2FA1L443 756 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 SIRT1Q96EB6 747 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAM1Q96QH2 718 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 TONSLQ96HA7 1378 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 PTCH1Q13635 1447 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 TECPR2O15040 1411 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRB1O14514 1584 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 ORAI2Q96SN7 254 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 BRINP3Q76B58 766 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 MST1RQ04912 1400 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 PHLPP1O60346 1717 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 DCCP43146 1447 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 DLC1Q96QB1 1528 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXO3O43524 673 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK19Q9BWU1 502 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-211ENST00000588374 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 PSME1Q06323 249 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 USP32Q8NFA0 1604 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 CABP2Q9NPB3 220 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 JCADQ9P266 1359 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHG5O94827 1062 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRB2O60241 1585 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 EVC2Q86UK5 1308 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF1AQ12756 1690 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 ITSN1Q15811 1721 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 SHPRHQ149N8 1683 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 CABP1Q9NZU7 370 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-211ENST00000588374 ACEP12821 1306 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 PXDNQ92626 1479 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS2O95450 1211 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP7BP35670 1465 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 TMC1Q8TDI8 760 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 TESK2Q96S53 571 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 LRP6O75581 1613 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms