RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CTIF-206ENST00000588345 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CTIF-206ENST00000588345 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CTIF-206ENST00000588345 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CTIF-206ENST00000588345 MYOM2P54296 1465 aa27.09■■□□□ 1.93
CTIF-206ENST00000588345 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.06■■□□□ 1.92
CTIF-206ENST00000588345 STK26Q9P289 416 aa27.06■■□□□ 1.92
CTIF-206ENST00000588345 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CTIF-206ENST00000588345 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.05■■□□□ 1.92
CTIF-206ENST00000588345 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CTIF-206ENST00000588345 SIRT1Q96EB6 747 aa27.03■■□□□ 1.92
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.03■■□□□ 1.92
CTIF-206ENST00000588345 AFF2P51816 1311 aa27.02■■□□□ 1.92
CTIF-206ENST00000588345 FMN2Q9NZ56 1722 aa27■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.99■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 HRCP23327 699 aa26.99■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.99■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 PXDNQ92626 1479 aa26.98■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 RXRBP28702 533 aa26.97■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.97■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 C8orf37Q96NL8 207 aa26.96■■□□□ 1.91
CTIF-206ENST00000588345 KIF1AQ12756 1690 aa26.92■■□□□ 1.9
CTIF-206ENST00000588345 DLC1Q96QB1 1528 aa26.92■■□□□ 1.9
CTIF-206ENST00000588345 FOXO3O43524 673 aa26.92■■□□□ 1.9
CTIF-206ENST00000588345 NUTM2FA1L443 756 aa26.91■■□□□ 1.9
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTS2O95450 1211 aa26.91■■□□□ 1.9
CTIF-206ENST00000588345 ADGRB1O14514 1584 aa26.91■■□□□ 1.9
CTIF-206ENST00000588345 NGLY1Q96IV0 654 aa26.89■■□□□ 1.9
CTIF-206ENST00000588345 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 STAC3Q96MF2 364 aa26.85■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 PRAM1Q96QH2 718 aa26.85■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 ADGRB2O60241 1585 aa26.84■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 RGS12O14924 1447 aa26.83■■□□□ 1.89
CTIF-206ENST00000588345 USP21Q9UK80 565 aa26.82■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.81■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.81■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.79■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.79■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 USP32Q8NFA0 1604 aa26.79■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.78■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 POGKQ9P215 609 aa26.78■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.78■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 ATRNO75882 1429 aa26.78■■□□□ 1.88
CTIF-206ENST00000588345 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.75■■□□□ 1.87
CTIF-206ENST00000588345 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.74■■□□□ 1.87
CTIF-206ENST00000588345 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.74■■□□□ 1.87
CTIF-206ENST00000588345 SBNO1A3KN83 1393 aa26.72■■□□□ 1.87
CTIF-206ENST00000588345 PSME1Q06323 249 aa26.72■■□□□ 1.87
CTIF-206ENST00000588345 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 SLIT2O94813 1529 aa26.69■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.69■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 ABCA3Q99758 1704 aa26.66■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.66■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF10O15013 1369 aa26.66■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.65■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.65■■□□□ 1.86
CTIF-206ENST00000588345 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.62■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.62■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 ALS2Q96Q42 1657 aa26.6■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.6■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 GLI3P10071 1580 aa26.59■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.59■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.58■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 ITSN1Q15811 1721 aa26.58■■□□□ 1.85
CTIF-206ENST00000588345 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.58■■□□□ 1.84
CTIF-206ENST00000588345 ATP7BP35670 1465 aa26.57■■□□□ 1.84
CTIF-206ENST00000588345 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.57■■□□□ 1.84
CTIF-206ENST00000588345 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CTIF-206ENST00000588345 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.56■■□□□ 1.84
CTIF-206ENST00000588345 VPS72Q15906 364 aa26.52■■□□□ 1.84
CTIF-206ENST00000588345 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.51■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.5■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.5■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 FAM83GA6ND36 823 aa26.49■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHG5O94827 1062 aa26.49■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 CDK19Q9BWU1 502 aa26.48■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 NRAPQ86VF7 1730 aa26.48■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CTIF-206ENST00000588345 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.45■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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